从tar压缩文件夹中仅提取某一个目标文件

有时候我们需要从tar压缩文件夹中仅提取某个目标文件,如果对整个压缩文件进行解压的话,未免太占用空间和资源,我们可以使用如下命令进行操作

IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...

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  • 发布于 2024-11-12 18:10
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一文教你绘制九象限图

一文教你绘制九象限图

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  • 安生水
  • 发布于 2025-01-24 09:00
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安装R包报错 fail to lock directory

这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录,这通常是因为之前的安装进程没有正确完成,导致锁文件(一个隐藏的文件,用于防止同时写入目录)仍然存在。

空间转录组数据读取

10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...

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  • 发布于 2024-11-13 16:56
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单细胞转录组镜像代码更新4.0

单细胞转录组镜像代码更新4.0

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  • 发布于 2025-01-13 11:48
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R语言绘制差异表达火山图

R语言绘制差异表达火山图

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  • 安生水
  • 发布于 2024-10-14 15:48
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用seqtk随机提取指定数目的序列

如果数据测多了,我们可以使用seqtk对fastq文件进行随机抽样来减小分析的数据量。

如何计算基因组中的连锁不平衡

连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)是指在某一个群体中,不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象,一般用D,D'和r²来表示LD的程度。

10X Visium空间转录组图像

10X Visium空间转录组图像

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  • 发布于 2024-09-19 13:20
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libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

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  • 安生水
  • 发布于 2024-08-22 15:05
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甲基化水平计算

甲基化水平计算

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-21 14:20
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌(HNSCC)(GSE181919)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肝细胞癌(HCC)代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里,我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组:原发肿瘤、门...

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  • 发布于 2024-10-31 14:05
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circos改变某两条染色体之间的距离

circos改变某两条染色体之间的距离

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  • 安生水
  • 发布于 2024-09-23 15:15
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R 安装github包报错:

R 安装github包报错:

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  • 发布于 2024-11-18 15:42
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R语言基础入门—R语言概述与安装!

R语言基础入门—R语言概述与安装!

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:43
  • 阅读 ( 1305 )

食管癌相关文章ESCC

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  • 发布于 2024-08-20 15:26
  • 阅读 ( 1297 )

R语言绘制多分组差异分析结果图

R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据  

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  • 安生水
  • 发布于 2024-10-25 13:52
  • 阅读 ( 1291 )

食管癌 10X多样本(GSE145370)

食管癌 10X多样本(GSE145370)

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  • 发布于 2024-08-22 16:48
  • 阅读 ( 1284 )

scanpy 中 ScTransform分析:

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  • 发布于 2024-11-20 08:23
  • 阅读 ( 1259 )