修改单细胞转录组分组
宏基因组测序技术是进行微生物资源开发利用、加速微生态科研深度研究的重要手段。随着高通量测序技术的普及,越来越多的研究人员开始着手与宏基因组分析。 但是,有相当一部分研究人员由于是初次接触宏基因组分析,对分析结果缺乏系统的了解,无法高效的挖掘和研究目的相关的结果,进而影响了文章的发表以及成果的转化。
基因交流分析是群体遗传学中研究种群间基因流动和历史关系的重要工具。本文将为你介绍几种关键的统计量,帮助理解它们的独特作用。 D统计量 D统计量,又称ABBA-BABA检验,是检测基因交流的...
tensorQTL :最高效的QTL 分析工具 用法介绍
在泛基因组研究中,结构变异(SVs)的检测是揭示物种内遗传多样性的关键环节。相比单核苷酸多态性(SNPs),结构变异能够解释更多的表型差异和适应性特征。今天我们就来深入探讨泛基因组分析中...
IF=4.2 | 不同西瓜品种果实品质的转录组代谢组联合分析
linux fail2ban-server 服务 添加信任IP
人类免疫细胞marker基因
“ 2025年2月 BMC Plant Biology杂志发表了一篇题为“Integrative transcriptome and metabolome analysis reveals candidate genes related to terpene synthesis in Chrysanthemum × morifolium...
一文教你绘制GO富集分析弦图,简单又好看
cactus-bin-v2.9.9 安装笔记
单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE131907)
前面的文章中我们给大家介绍过eQTL和sQTL的概念, 大体总结一下,eQTL是指基因组上的一些突变可以改变相关基因的表达,sQTL是指这些突变同时也会导致可变剪接的差异,实际上这两个都是归于一个叫...
在群体遗传学中,选择清除、连锁不平衡和单倍型是三个紧密关联的核心概念,它们共同帮助我们理解自然选择如何在基因组上留下印记。今天先来说说选择清除分析。 一、 核心概念解析 选择清除:...
多组学联合分析—桑基图
不同物种构建泛基因组的时候需要用到Progressive Cactus 参考文章:Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomic 下载: 软件github:https://github.com/Comp...
报错: 运行cactus-pangenome的时候报错: [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus...
IF=4.8 | 联合转录组与代谢组分析揭示了硒对百合生长和品质的影响
进行gsea分析的时候需要gmt文件,需要到官网进行下载。官网需要注册一下才可以进行下载。 官网网址:https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp 直接进入http://www.gsea-msigdb.org/gsea/d...
生物信息学分析,Skill推荐清单