omicsgene
deepseek绘图之--系统发育树
在群体遗传学研究中，构建系统发育树是解析群体遗传结构和演化历史的核心手段。无论是单核苷酸多态性（SNP）分析、单倍型网络构建，还是群体分化研究，研究者常面临一个挑战：如何将复杂的群体...
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- Ti Amo
- 发布于 2025-04-30 09:42
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Ti Amo
安生水
R语言绘制多分组差异分析结果图
R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据
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- 安生水
- 发布于 2024-10-25 13:52
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Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具
在群体遗传学研究中，我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传...
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- Ti Amo
- 发布于 2025-04-30 10:31
- 阅读 ( 1462 )
HiC-Pro 报错检索解决
报错： 运行HiC-Pro的时候出现报错： 去看log文件发现： 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找： 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件，看一...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-28 15:12
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IF=4.3|棉花GT64基因家族的泛基因组分析及对黄萎病的表达响应
“ 2024年9月BMC Plant Biology 杂志发表了一篇题为“Pan-genome analysis of GT64 gene family and expression response to Verticillium wilt in cotton”的泛基因家族文章。” 该文章对8种棉...
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- rzx
- 发布于 2025-01-24 16:20
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rzx
PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-09-30 13:50
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idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住
idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住
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- omicsgene
- 发布于 2024-09-29 17:18
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deepseek绘图之--微生物堆叠柱状图
在微生物组研究中，揭示群落组成与动态变化是核心任务。无论是16S rRNA测序、宏基因组分析，还是环境样本的物种丰度比较，研究者常需面对一个关键问题：如何直观展示多个样本在不同分类水平（如...
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- xun
- 发布于 2025-04-28 16:09
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xun
IF=4.3 | 秋茄树SOS1基因家族分析
“ 2024年8月《BMC Plant Biology》发表了一篇题为“SOS1 gene family in mangrove (Kandelia obovata): Genome-wide identification, characterization, and expression analyses under salt and...
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- rzx
- 发布于 2024-12-04 10:11
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已知集合交集数量绘制韦恩图
大部分R包无法直接根据已知的交集数量绘制 Venn 图，必须依赖提供的集合元素列表进行计算，但是少部分R包可以，比如VennDiagram包
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- 每天学习一点点
- 发布于 2025-03-06 15:13
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每天学习一点点
