给进化树标定化石时间

进化树(Phylogenetic Tree)是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每个分支点(节点)代表一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-10 17:43
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8月相约南京--群体遗传进化GWAS分析、T2T基因组、泛基因家族、宏基因组等主题培训!

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在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件

libpcre2-8.so.0是PCRE(Perl Compatible Regular Expressions)库的一个版本,通常用于支持正则表达式。

An introduction to PERMANOVA and ANOSIM

PERMANOVA(Permutational Multivariate Analysis of Variance)和 ANOSIM(Analysis of Similarities)都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域,...

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  • 发布于 2024-06-05 14:33
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DockerHub镜像无法下载的解决方案

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  • 发布于 2024-08-30 16:31
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甲基化水平如何计算

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  • 安生水
  • 发布于 2024-07-11 09:51
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非负矩阵分解(cNMF)

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  • 发布于 2024-09-24 18:11
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单细胞转录组-infer CNV拷贝数变异分析介绍

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  • 发布于 2024-08-26 17:20
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绘制Upset 图

Upset 图(Upset Plot)是一种用于可视化集合间交集的图表,是传统维恩图的替代方法,特别适用于集合个数多或交集关系复杂的场景。它通过柱状图、点图和辅助条形图来直观展示集合交集的大小及分布。

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  • 发布于 2024-11-28 11:01
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LD衰减距离

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  • 发布于 2024-06-27 09:50
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使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

在做eQTL分析时需要提供隐藏因子作为分析的部分协变量,分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素,例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等,这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的,但是会影响基因表达的因素),需要进行预先处理。

qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度

qsub全称为”Queue Submitter”,是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中,等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...

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  • 发布于 2024-06-26 17:54
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bowtie2 将fasta序列比对到参考基因组

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  • 安生水
  • 发布于 2024-08-16 10:26
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R语言中%>% 作用

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  • 安生水
  • 发布于 2024-09-02 14:24
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删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy"

删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy",是什么问题,如何解决

Scanpy数据结构:AnnData

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  • 发布于 2024-10-11 15:42
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GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

单细胞数据挖掘示例代码

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  • 发布于 2024-06-11 17:18
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌(HCC)(GSE149614)

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  • 发布于 2024-07-23 10:33
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)

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  • 发布于 2024-06-27 13:48
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基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的,用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb (transcript database)包,有两种构建方式,一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:45
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