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老师，请问分析fasta格式的文件需要全部转成gff格式再分析吗？

  • 2025-02-26 23:00
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3 docker 安装

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为啥我搜不到镜像啊

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使用lordec 利用二代数据校正三代数据

  • yy 2025-02-26 10:53
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3 老师，在泛基因列表构建时，总共113个基因组，成功提取了最长转录本，提取bed文件，但提取cds文件时，有一个文件A10总是失败，不知道什么原因。

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老师，结构变异与基因表达分析中，运行这条指令（删除一些不需要的基因表达量，得到的结果为0），下面为一些过程文件的前几行内容，请老师看一下什么原因

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二代DNA测序数据进行kmer分析，结果如下图，想请问可能的原因和建议。

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构建泛基因列表，提取最长转录本这一步，运行几个小时之后没有结果是怎么回事？

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xpclr报错AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys'

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20 文献分析，只有BigWig文件能否完整做出下面的图像

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老师，结构变异的基因注释；建立注释库后，运行结果出错，如下图；提取结构变异信息时，我提取了一个样本的tsv的染色体，起始，终止，0，0；运行#注释的代码，生成的外显子文件为0；请问应该如何操作？PsbM是参考基因组，PsbF为一个样本

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10 重启后还是没有Hyper-V选项，是什么原因导致的呢

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老师，想用ka/ks值画一个热图，而不是筛选大于1的基因做热图，请问如何修改代码及脚本？

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下载VirtualBox，显示 安装时发生严重错误 是为啥啊？

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老师，请问泛基因家族成员鉴定中，hmmer结构域搜索；；我有两个结构域，而hmmersearch一次只能筛选一个结构域；请问如何筛选同时含有两个结构域的呢；请问这两条指令如何修改？

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在运行table_annovar.pl脚本的时候报错

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运行hmmsearch返回结果为空，后来再试时报错

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我用Evolview做了一个进化树加热图的图，我怎么把图例里面的白色对应刻度0啊

  • 2025-02-10 22:30
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老师您好，有两个基因家族的PFAM号是一样的，是不是代表可以归类为一个基因家族

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老师，这是某一个最长转录本的保留；；请问#Ensembl 下载的基因组 会在基因和mRNA ID前面加gene: 和 transcript:这里给去掉；；这条指令是不是对应下图中要删除掉ID后面的gene mRNA exon CDS等信息呢？