你好老师 我要分析的基因家族 需要 2 个结构域(PFxx + PFxx),必须两个同时命中,才是 我要分析的,所以要额外做提取 ID + 求交集对吗

但是拟南芥演示只用了这三步#用wget下载链接,-c:断点续传

wget -c https://www.ebi.ac.uk/interpro/wwwapi//entry/pfam/PF03106?annotation=hmm -O WRKY.hmm.gz

#解压缩

gunzip WRKY.hmm.gz


#用hmmsearch鉴定基因家族

hmmsearch --domtblout WRKY_round1_hmmerOut.txt --cut_tc WRKY.hmm ../01.data_prepare/Arabidopsis_thaliana.gene.pep.fasta

我自己的物种问ai要全部两次hmmsearch跑完之后,再提取ID、求交集
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  • 幸运鹅 提出于 12小时前

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