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按照课程输入命令，但是报错显示没有这个命令

  • zjc 2025-04-23 11:14
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老师您好，我测定的是土壤微生物的宏基因组，在进行物种注释时选择的kraken的标准库，但注释出来可比对的物种注释率较低，好几个样本都低于30%，这样合理吗？如果不合理，我该如何解决呢？

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宏基因组得到的物种相对丰度表进行kw差异分析或者Lefse分析时，对数据提前进行对数处理合理吗

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有两个基因不在染色体上在contig上，为什么会这样，图片里的contig可以删掉吗，会有什么影响吗

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pav分析，在写文章的时候应该如何写怎么到PAV呢？我是通过课程输入代码来的，写文章怎么写呢？

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根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单，在标识了转录本的蛋白质序列文件中搜索，可以把IDlist名单中的所有转录本蛋白序列搜索出来吗？可以改命令达成？这是我的命令seqkit grep -f Nramp_IDlist_final.txt arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa -o Nramp_pep_final.fa 我把IDlist里面名单后面都加了转录本号才搜出来。？

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卸载重装后docker后为啥docker pull omicsclass/organelle-assembly:v1.0怎么下载不了这个镜像了

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braker注释结果有问题

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在进行GWAS的LDBlock可视化中，在Win11本地的Docker执行LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region Chr1:36000000-37000000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt -PointSize 0.8命令时，程序居然报错UnKnow argument -PointSize，请问这是怎么回事呢，如何解决呢？请组学大讲堂的老师麻烦回答一下！谢谢！

  • John 2025-03-12 16:57
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老师，我现在在学习泛基因组分析，研究物种是梨；现已找到13个基因组，那我在基因家族鉴定的时候用13个基因组；而泛基因集的构建我需要选择几个？

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老师您好，我在参考基因组比对的时候，出现报错，请老师解答

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ParaAT批量比对出现问题，这个是怎么回事？

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绘制核心基因和可变基因饱和曲线时提示错，检查文件没有问题。

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老师我做存在缺失分析部分，Fam_gene.list中泛基因编号为什么不是连续的呢

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老师，为什么我把data数据链接过来的时候链接不过来，会出现这样页面？

  • 2025-03-07 09:30
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下载VirtualBox，显示 安装时发生严重错误 是为啥啊？

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加载本地镜像，中断之后再也加载不起，咋整？

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求老师解答，docker run 出错

  • Oho 2025-04-20 11:38
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泛基因家族分析

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错