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老师，我研究的植物有人已经构建了泛基因组，用的从头组装比对的方式，我想问一下，如何利用他的数据做我的研究，我可以添加几个自己的物种进去吗，请老师给个研究思路

  • Oho 2025-03-27 10:25
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circos绘图

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老师请问，怎么把这些文件像您一样做成一个文件在数据库里确认结构域

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老师您好，做染色体水平基因组组装与注释，没做核型分析，可以推测染色体条数吗

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基因ID

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perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本，但脚本在我设置的路径中，不知道该怎么解决

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5 叶绿体基因组组装过滤代码错误

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请老师帮忙解答，运行的构建泛基因组图谱的代码，生成的文件比视频中少很多

  • Oho 2025-04-27 12:19
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卸载重装后docker后为啥docker pull omicsclass/organelle-assembly:v1.0怎么下载不了这个镜像了

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connection because has no HTTPS proxy: connecting to index.dock这是

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数据质控出现报错

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蛋白互作，该下载哪一个结果txt文件。

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connect

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使用独享服务器A，256G内存，hifi组装t2t基因组（基因组1g，hifi测序60x），命令运行很久后，竟然自动kill，是内存不够吗

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保留蛋白编码基因运行就这样，不能回到docker ，怎么解决？

1 解决

泛基因家族分析数据准备

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泛基因家族分析

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A基因家族的家族成员一共25个，但是23个成员是一个domain，只有是两个domain,这种情况，比较这个基因家族里面不同成员的蛋白全长是不是不合适？不容易得到25个成员的全蛋白进化树？

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不同物种之间的共线性分析，出现问题，望解答、谢谢