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基因组重复序列注释使用的input.fa文件和注释后屏蔽的区域

  • tt 2025-04-29 12:11
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Rscript $scriptdir/gapit_gwas.r -i /work/hapmap.txt.gz -t /work/Sugar.txt -m GLM -n hd.GLM.GWAS.Results 就是我执行完这个命令，一直在这个界面，等一个多小时都没反应，hapmap文件大小260M，是还在运行，还是哪里错了

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染色体定位 单位如何标识？用mapchart如何标识标尺单位。

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老师您好，我在参考基因组比对的时候，出现报错，请老师解答

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运行MCScanX查找共线性，java绘图出现错误为什么？

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下载VirtualBox，显示 安装时发生严重错误 是为啥啊？

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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢

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新建物种特异hmm模型，再次搜索，产生的文件round2_hmmerOut.txt中的一个基因序列（下图所示），通过了三大数据库确认。但是序列很短，这个序列不要？

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请问老师，我重新修改了软链接，但是基因组序列文件和注释文件批量链接还是出错，为红色

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重测序中SNP分析

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请问，gff文件打开后没有biotype,就不用运行保留蛋白编码基因那个命令了吗？

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IBD 计算2

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ParaAT批量比对，该怎么执行+X？

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提取cds 用基因的ID，作为序列的ID，报错，咋整？

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omicsclass/pan-gene-family 为啥这个我在docker hub上没有找到呀

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hisat2中提示"/work/my_rnaseq/ref/Gmax_508_v4.0.fa" does not exist

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为啥我搜不到镜像啊

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泛基因家族分析家族成员存在缺失分析，获取PAV_gene.list和Fam_gene.list

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重测序中SNP分析

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老师，我现在在学习泛基因组分析，研究物种是梨；现已找到13个基因组，那我在基因家族鉴定的时候用13个基因组；而泛基因集的构建我需要选择几个？