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请问pfam 模型下载选择那个是？ hmm后缀的文件还是seed 文件？

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基因家族分析

1 解决

泛基因家族分析

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根据组装后基因做的物种注释，还需要做稀疏曲线吗

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老师，拟时序基础初步分析时，运行以下代码时Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../04.cell_type_ann_leaf/leaf.added.celltype.qs \ --use.seurat.umap --groupby mycelltype -o monocle3.1 --cpu 6，出现图中报错，是因为聚类分群的时候resolution值太低了吗

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请问我在做性状绘图时出现报错，我的数据格式应如何修改

  • Max 2025-09-15 11:23
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老师您好，在GWAS后分析添加基因与环境的交互项，使用什么方法比较好啊？

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老师您好，我在运行OrthoFinder2时，出现下面报错，请老师解答

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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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组内共线性分析，为什么不能出图呢？

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16S课程 03.asv_taxonomy

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基因家族分析时，提取cds与pep序列报错显示 no sequence

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绘制热图所用数据的样本或处理如何确定

  • 2025-05-23 15:37
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在进行进化树分析时，运行出clean.sorted.vcf.gz文件后，后续文件跑不出来了，报错原因如图所示

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泛基因筛选最长转录本时出现问题

  • Yang 2025-07-03 22:25
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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

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老师，我做共线性分析时，出现了以下错误，什么也生成不出来

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我改正了这些错误，但是还是无法把data里的数据软连接道01 data prepare上，不知道哪里出错了，基因文件和gff文件没有问题

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老师我200个样本的重测序测完以后，构建进化树时进化树的分群信息和我样本的来源信息不同，该怎么解决呀

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老师您好，做比较基因组分析时，单拷贝同源基因的这个文件是空的Orthogroups_SingleCopyOrthologues，并且orthofinder文件夹也是空的，是什么原因造成的