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泛基因家族-结构分析

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我的关注的头足类和其他贝类的进化关系，涉及5个头足类物种4个其他贝类，基因集这里基本上都包括这五个头足类物种了，是说明头足类物种进化出或者在这些富集基因多的通路上和其他贝类不同了吗？

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在基因家族筛过程CD-searcch结果中如果显示结构域N端C端或者NC端不完整，这个序列还能留做某一基因家族成员吗

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dadi

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老师，在初步查看cluster分群信息时，能否使用--cols代码，实现对某个cluster的颜色进行改变，具体代码是什么

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泛基因家族分析

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泛基因家族分析-SV和基因表达量

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转录组比对中，同源性很高的两个基因比对不正确

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泛基因家族分析-SV和表达量

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老师想问一下，为什么我在myt2t文件下面创建，但是最后跑去了家目录下面呢，试了好几次了，而且我echo $workdir了确实也是指向的是myt2t这个文件

  • Nier 2025-09-15 12:06
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Xpclr

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老师，我要分析几个品种的基因表达量数据，在公共数据库大部分只有叶片组织的播种24天及以后的数据，我都选取播种24天的数据进行转录组分析可以么，另外我想以其中一个品种作为参考基因组，我是不是需要把这个基因组的fasta文件和gff文件建立索引，然后再分析这几个基因组的rnaseq数据，包括参考基因组的ranseq

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smooth.value

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你好，我在做小麦GWAS分析时，按照脚本过滤生成clean.vcf.gz文件，文件变得非常小怎么回事，修改过滤参数还是一样，到进化树分析时显示文件为空，有人能解答吗

  • Max 2025-07-15 11:10
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泛基因集执行命令时，由syn.txt文件到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时会丢失一些基因吗？我做自己的物种分析时发现丢失了一些基因，是什么原因？这正常吗

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deepTE.py报错

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PGGB泛基因组报错

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VCF文件按照指定的染色体排序

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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因家族分析-SV和表达量