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老师您好，在GWAS后分析添加基因与环境的交互项，使用什么方法比较好啊？

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老师您好，我在做物种间多线性分析时出现如下错误，希望您可以帮忙给看看，感谢！

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蛋白3D结构预测

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3 win11下，docker无法start

  • 2025-07-11 22:26
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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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为挂载到染色体上的基因家族成员能否绘制基因在染色体上的定位图？

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GWAS分析的表型数据不符合正态分布，但是极值材料表型是真实存在的，所以是保留原始数据还是用IRNT转换表型值或者剔除不符合正态分布的值呢

  • 2025-07-11 23:22
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docker镜像搭载不上

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老师您好，我做MCScanX 进行blast建库时总是报错，文件前加上绝对路径也还是报错显示文件不存在

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泛基因家族分析

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使用GSDS来可视化基因的顺势作用元件，发现有些元件显示不出来。只能修改那些元件颜色和形状，不能移动元件标识。用那个GSDS自带的edit功能，进去之后之前修改的元件形状又变成修改之前的样子，edit只能移动不会修改元件颜色和形状，也不会保存到本地。请老师给想个办法？

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进行GTDB注释时报错，报错信息为缺少参考基因组

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老师，我做PAV分析时，“提取物种间泛基因编号相同的基因为同一基因”，这一步时产生的“maize.PHYgene.pan-genes.list”，只有几个基因，其他文件都正常，这是怎么回事

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用R可视化snp分布的时候出现错误：WARNING: ignoring environment value of R_HOME Fatal error: cannot create 'R_TempDir'

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老师我的基因组都是Scaffold，没有染色体级别的基因组，这种适合做泛基因家族鉴定么。我是在BnPIR(http://cbi.hzau.edu.cn/cgi-bin/rape/download_ext)下载的

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Error, no sequence for chr1 at /wcr/TransDecoder/util/gff3_file_to_proteins.pl line 82.

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cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决

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老师我一个一个步骤进行，一个基因一个基因分析，是这个命令有问题才出现domain_final.bed只有一个基因，代码有问题么:grep -v '#' ZS11.v10.FAE1_hmmerOut.final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >ZS11.v10.domain_final.bed,这是我刚刚使用的这步的代码，前一步产生的hmmerOut.final.txt文件还整常

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蛋白3D结构预测

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老师，cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决