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泛基因，运行代码时出现错误

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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢

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全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题

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hmmsearch --domtblout ./${ind}.WRKY_hmmerOut.txt --cut_tc ./WRKY.hmm ./${ind}.gene.pep.fasta;;我有两个结构域，需要如何更改呢？

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老师您好，我在运行alpha diversity calculation 这段代码时出现报错信息，没有alpha_diversity.py这个文件，校验了下提供的代码确实没有，售后老师说可能是软件自带的，请问这种情况改如何解决？alpha_diversity.py，beta_diversity_through_plots.py，make_2d_plots.py，nmds.py，upgma_cluster.py这些都没有

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宏基因组数据预处理问题

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执行ALLHiC分组不成功

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老师，结构变异与基因表达分析中，运行这条指令（删除一些不需要的基因表达量，得到的结果为0），下面为一些过程文件的前几行内容，请老师看一下什么原因

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老师，保留最长转录本之后，提取cds和pep，过程出现这个界面，请问哪里有问题吗？

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5 单细胞测序进行拟时分析绘制细胞骨架图

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老师，您好， 我想问一下选择清除分析fst和pi结合的图的曲线为什么变细了？ 我用红色框线圈起来了

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想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

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宏基因组基因定量salmon

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测序文件中提取基因序列

  • bomm 2025-03-09 22:57
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docker连接不上

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请问老师，为什么显示找不到文件呢，已经尝试过重新传输文件

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基因家族分析，最长转录本，复制的命令，还是报错。咋整

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老师，合并后的VCF文件，现在有几品种不想要了，如何从总的VCF文件中删除这几个品种的数据

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老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

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老师，别人发的一篇泛基因组文章，应该是从头组装构建的，每个基因组对于参考基因组的SV，是不是用他们这个SV文件就可以合成图谱，就是一堆SV怎么搞成线性化，跟正常基因组一样的，作为一个参考基因组，这个是可行的吗，如何操作

  • Oho 2025-03-27 20:31