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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢

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想咨询一下，我有1批宏基因组数据，可不可以样本对半，分成2次进行

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基因结构注释效果不理想

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构建泛基因列表，提取最长转录本这一步，运行几个小时之后没有结果是怎么回事？

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想咨询一下各位老师，宏基因组注释的时候，我有总共160G的土壤宏基因组数据(21个样本)

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IBD 计算2

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老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

  • John 2025-03-18 15:15
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老师，就是我在做结构变异分析那里，我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀，谢谢老师

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ka/ks分析，拆分泛基因列表，缺少一个基因，泛基因列表有38个，而拆分出的文件只有37个

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10 重启后还是没有Hyper-V选项，是什么原因导致的呢

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10 大家好，我想问一下，做进化树分析，想把一些文件从一个文件夹cp到新建的进化树的文件夹，但是cp的时候说找不到这些文件，但这些文件就在哪里，不知道这是什么原因呢，直接复制粘贴过去也不太行，在终端里ll一下依旧找不到。

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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释

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新安装docker desktop为什么显示docker engine stopped

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GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 第二，你们的GWAS课程提供的计算BLUP的脚本是否在不同物种之间通用 第三，做GWAS时，基因型填充对后续的分析有什么意义。 第四，你们GWAS课程有没有计算遗传力相关的脚本。

  • John 2025-03-12 15:37
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xpclr报错AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys'

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docker search 出现错误是怎么回事

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如何下载别人的重测序数据

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genomescop2有没有办法出pdf的图片呢

  • 2025-01-20 15:14
2 解决

10 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后，染色体出现了一个超级染色体，各染色体大小分布非常不均匀

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老师，我的基因组有113个，今天运行整理泛基因集列表中共线性分析生成pangene.bed和pangene.cds那一步，已经运行了18个小时了，才运行到79个基因组，其他步骤也是，比较慢，有没有快一点的方法呢？与网络有关系吗，换一个快的网线能加快进度吗？或者有没有其他命令可以加快。