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合并GVCF文件

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想问一下泛基因集的构建，如果有相关参考文献有泛基因组的构建是不是我就不用学习这部分内容了；想问一下什么情况下才需要构建泛基因集？构建泛基因集的目的是什么？

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我鉴定的家族成员的基因ID和已经发表文献的基因ID不一样，如何让两者对应起来？下图左侧是文献中的基因ID，右侧是我鉴定出来的基因ID，数量一致。

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5 juicer 报错： Failure during chimera handling of

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老师我在解压eggnog.db.gz文件时显示失败

  • Oho 2025-03-08 09:57
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泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错 core dumped

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关于填充gap后的polish

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老师您好，我在参考基因组比对的时候出现报错

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基因家族结构分析，为什么会出现下图图形盖住基因名的情况，怎样可以改正呢

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想问一下视频课程里的data内容换成自己的数据就行了嘛？

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老师，我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令；视频中data数据中为gff的后缀，我的数据是gff3的，把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗？

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运行hmmsearch返回结果为空，后来再试时报错

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老师您好，有两个基因家族的PFAM号是一样的，是不是代表可以归类为一个基因家族

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IBD 计算2

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GO富集分析气泡图怎么画

  • lw 2025-03-02 17:25
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老师，我在做dadi分析的时候，发现没有代码里显示的easySFS.py的脚本，给的文件里也没有，就一直报错

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在筛选GWAS关联区域内的基因时（LDBlock），基因或者SNP与选定的显著关联区域有百分之多少的交集可以定义为关联区域内的基因或者SNP？视频中说是10%，视频说的10%请问通用吗？这个10%是如何计算的？

  • John 2025-03-12 15:32
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从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻泛基因分析出

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老师，请问tbtool安装之后，用不起。无论点不点确定都不行，咋整？

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泛基因家族，典型基因和非典型基因的热图怎么做？