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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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老师您好，我在运行这段代码时没有任何反应，请问是出现了什么问题？Oryza文件里是水稻的参考基因组

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老师，保留最长转录本中，过程文件出现了take into account

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基因家族分析环境变量

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GWAS分析筛选关联区域

  • John 2025-03-11 18:46
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bash:docker:command not found是什么情况，还有就是根据我这个目录如何运行docker run --rm -it -v /share/work/huangls/piplines/omicsclass/pop-evol-gwas/scripts/:/work/scripts -v /share/nas1/huangls/test/gwas_rice:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v2.0这条命令，怎么进行修改

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可以分析多个序列中两个序列的相似性吗？下图有多个序列，这么比对后，发现两个一样的序列都无法配对。如何比对多序列的两个序列。

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进化树制作，背景我设定的只是一段，为什么提交之后全部基因都有背景。

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想问一下，为什么我用pfam筛选，结果出来是这样的，没有能看结果的地方，也没有能下载的地方

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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GWAS分析绘制QQ图时，Observed值与Expected值相差较大

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The CDS sequences do not match the gene sequences.

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我想把vcf文件转换为hapmap文件，一直跳出来这个提示，是什么原因

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提取cds 用基因的ID，作为序列的ID，漏掉了一个序列，咋整？

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泛基因家族分析

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对宏基因组的分类和功能数据去除低丰度数据时，论文中经常采用0.1%,0.01%或者不说明，我可以采用其他取值不在文中说明吗

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老师，我的结构变异文件是5个梨品种，转录组数据中与sv相同的品系，只有3个，这个影响吗？

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linux终端如何打开一个应用的GUI

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老师这个示例文件夹里没有东西，我cd到01.prepare_data文件夹下里面时候空的

  • Oho 2025-03-09 11:43
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请问在做SSR分析用circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢，完全粘贴课程内容中的conf配置文件