0 回答

老师我200个样本的重测序测完以后，构建进化树时进化树的分群信息和我样本的来源信息不同，该怎么解决呀

1 回答

我改正了这些错误，但是还是无法把data里的数据软连接道01 data prepare上，不知道哪里出错了，基因文件和gff文件没有问题

0 回答

老师，我做PAV分析时，“提取物种间泛基因编号相同的基因为同一基因”，这一步时产生的“maize.PHYgene.pan-genes.list”，只有几个基因，其他文件都正常，这是怎么回事

1 回答

老师您好，做比较基因组分析时，单拷贝同源基因的这个文件是空的Orthogroups_SingleCopyOrthologues，并且orthofinder文件夹也是空的，是什么原因造成的

1 回答

eggnog_file_process.r好像就是将同一功能下不同基因直接相加

1 回答

老师，我手动生成了domain_final.bed，但是出现了以下情况，检查了相关文件都能打开，我是做成和share文件里domain_final.bed一样的txt格式，然后在FZ上加后缀bed改为bed格式，请问哪里有问题

0 回答

老师您好，我想问一下，一个鉴定出来的基因ID它的CDS序列开头是TAC而不是ATG,那这个基因可以保留吗

1 回答

泛基因家族分析进化树构建

1 回答

共线性分析，最后一步出不来pdf。看不懂提示。

0 回答

Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

1 回答

泛基因家族分析绘制kaks>1频率分布的热图

1 回答

泛基因组分析，磁盘配额不足

  • Yang 2025-07-26 16:31
0 回答

老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

  • Max 2025-07-09 17:50
1 解决

泛基因家族分析数据准备

1 回答

泛基因组分析教程中的env.sh文件运行自己相应物种时，里面的命令行是不是要进行修改如下图所示

1 回答

老师，在做蛋白预测的时候总是显示desired structure doesnot exist.

2 回答

老师，想问一下您，用blastp方法做基因家族成员鉴定时，鉴定到了51个成员，其中有几个成员的蛋白序列相似性大于98%，但是位于不同染色体上，这种是否需要删除多余的，只保留一条就够了？

2 回答

执行cat ../id.txt|while read ind;do ln -s ../data/${ind}.fa.gz ./ ln -s ../data/${ind}.gff3.gz ./命令时，打开01.data_prepare文件里面的内容显示如下图所示

1 回答

tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存

2 回答

存在缺失分析