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请问现在T2T的组装,还需要先除掉和细胞器DNA相关的reads再进行组装吗?组学大讲堂的课里面除掉了相关的reads。但是我看现在的论文,似乎都没有对细胞器的DNA进行单独的处理。
T2T基因组组装
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三代测序
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yuechao
提出于 2天前
相似问题
tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存
1 回答
allhic进行染色体挂载,分组过程k=20,只分了一个组出了
1 回答
T2T基因组组装,去除自冗余,发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题(17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences),后续awk命令报错。如下图
1 回答
tgsgapcloser报错
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