老师,我做泛基因家族鉴定时,06.SV_analysis最后得到的All.final.sv.out基因结构变异信息只有一条,请问哪里可能有问题

attachments-2025-08-i9vPF8WO689a1d19dbfbb.pngattachments-2025-08-FUwhGHBV689a1d2010766.png这个文件是空的

attachments-2025-08-ycK7tOYN689a1d2f094c7.png这个文件正常

attachments-2025-08-n2MdYOju689a1d41492f1.png这个文件没有变异类型,和教程示例不一样

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1 个回答

rzx

1.确认输入all_merge.vcf文件是否是结构变异文件
2. 与demo示例数据为参考,确认中间文件格式正确,注意文件格式问题,https://www.omicsclass.com/question/8061/answer/7356
3. 手动确认泛基因的变异信息,如果同物种的话,变异信息少。也可能结果就一条

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