prodigal预测基因后会去除partial=00的contigs

prodigal预测基因后会去除partial=00的contigs.但是我想使用metagenemark预测基因其输出的核苷酸文件没有partial信息,那是否过滤partial=00的contigs不是必要的

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1 个回答

xun - 电路元件工程师

对的可以不过滤

本质上就是让预测出来的基因更完整

在contig长度较短然后总数不多的情况下,其实prodigal也可以不过滤的


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  • murakami 提出于 2天前

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