没有出问题的,minimap相比其他软件已经快了很多了,
如果有需求或者资源充足可以调高线程数
@后面的
运行了这个代码minimap2 -t 12 -ax sr \
/work/demo/4.assemble/megahit/${i}/${i}.contigs.fa.min \
/work/demo/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_1.fastq \
/work/demo/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_2.fastq \
| samtools view -@ 12 -b -f 12 -o /work/demo/4.assemble/megahit/${i}/${i}_unmap.bam -后出现下面这个,这个太慢了吧,是哪里出问题了吗