1. K-Dense AI公司开源的科研技能合集
这套skills的覆盖面相当广：
- 28+科学数据库直连（PubMed、ChEMBL、UniProt、COSMIC等）
- 55+Python科研包集成（RDKit、pydicom、Scanpy、PyTorch Lightning、BioPython等）
- 15+实验室系统对接（Benchling、DNAnexus、LatchBio等）
- 30+分析与写作工具（文献综述、论文写作、同行评审等）
覆盖生物信息学、药物发现、临床研究、医学影像、材料科学、系统生物学等16个主要研究领域。
单细胞分析：做单细胞RNA-seq的同学应该知道，Scanpy和scvi-tools是这个领域的标配。现在可以直接在Claude Code里调用，从数据预处理到细胞类型注释一气呵成。还能对接CELLxGENE Census，访问6100万+单细胞数据。
地址： https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills
2.bioSkills
是 GPTomics 团队开源的、面向主流 AI 编码代理的标准化生信领域技能知识库与提示词工程框架。
其核心价值是：把生信领域的专家经验、工具规范、最佳实践、质控标准，封装为 AI Agent 可直接检索、理解、调用的最小技能单元，彻底解决通用大模型生信代码生成的「幻觉频发、参数错误、流程不规范、结果不可复现」四大核心痛点，实现「自然语言描述生物学问题→AI Agent 调用标准化技能→生成可验证的生信代码→输出可复现的分析结果」的全链路闭环。
•总技能数：438 项，覆盖 63 个生信分析子领域；
•端到端工作流：41 个，覆盖科研场景 90% 以上的常规分析需求；
•工具覆盖：兼容 100 + 主流生信工具，包括 Python/R 包、命令行软件，覆盖 NCBI/Ensembl/UniProt 等主流数据库。
•GitHub 主仓库：https://github.com/GPTomics/bioSkills
Claude Code 安装
git clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git
cd bioSkills
./install-claude.sh # Install globally
./install-claude.sh --project /path/to/project # Or install to specific project
./install-claude.sh --categories "single-cell,variant-calling" # Install specific categories
./install-claude.sh --list # List available skills
./install-claude.sh --validate # Validate all skills
./install-claude.sh --update # Only update changed skills
./install-claude.sh --uninstall # Remove all bio-* skills
