如何看懂微生物多样性分析当中三元相图ternary
三元相图查看说明
微生物多样性分析当中，三元相图Ternary图可以展示物种在不同分组当中的相对丰度的大小：
三元相图当中，不同的点代表不同的属，当然也可以是其他的分类水平，点的大小代表了该属在不同分组当中平均丰度，点的颜色代表了该属来自于哪个门，具体门所代表的颜色看图例。三元相图只能对三个分组或者三个样品当中物种的相对丰度进行展示，点的位置代表了该属在不同分组当中的相对丰度大小：
比如，如果要查看day42中淡蓝色的属的丰度大小，需要以这个点（属）为中心，绘制与day42对面的底边相平行的平行线，平行线与day42颜色一样的边相交的点，箭头处即为该属在day42中的相对丰度大小，标尺为百分数，如下图所示：
其他分组当中，也是一样查看的，这里举个例子，三元相图其实是三个图的叠加的：
点的大小代表OTU的相对丰度，是三组所有样品的平均丰度，通常是千分比，再经log2变换，转换数值范围为0-10之间；
视频课程见：https://study.omicsclass.com/index
- 发表于 2018-06-13 13:07
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- 分类：宏基因组
