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如何将提取domain的脚本修改为提取所有domain？

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MCScanX 下游dual_synteny分析

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请问脚本在哪里下载呢？

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转录组取样应该注意些什么？

  • 2019-07-11 14:41
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关于meme motif

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5 关于mirna预测靶基因数据库的下载

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WGCNA中运行给的filter代码后显示没有变量 如何解决

1 解决

10 在使用bio-linux中的meme分析蛋白保守结构域的时候出现问题。

  • dec. 2019-07-10 10:43
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我的hmmsearch结果第一列（target neme）不是geneid 也不是转录本id

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5 Biolinux 共享文件夹 command not found

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利用perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID，多个转录本ID保留一个作为基因的代表

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老师，您这里GEO芯片挖掘的课程是针对单通道芯片还是双通道芯片的呢，还是都有，因为我需要双通道芯片的数据挖掘课程

2 解决

5 bioLINUX 共享文件夹 command not found

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使用mega7 根据hmmsearch结果得到的confirmed domain构建进化树，出现如下错误，请问如何解决？

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一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的，这个文件中我看值应该是去过log2的，我看网站介绍说文件里面的值是Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1，这句话是不是意思是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据，如果是的话我可以直接看出基因的差异表达了，我可以直接拿这个数据来作图说明我所研究的基因家族成员发生了差异表达吗？因为在文献中也没有见过这种情况的作图，希望老师指点一下，谢谢老师

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5 您好，我再用ftp上传数据到NCBI上出现了和您一样的问题，请问您解决了没有呢？

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5 如何用荧光定量验证转录组结果

2 解决

5 您好，我想问下如果我的基因家族有两个结构域，两个pfam号，我应该怎么筛选呢？？

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5 你好，我在MCScanX共线性分析过程中用get_gene_position.pl提取基因位置信息的过程中，提取的信息不太对

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图一与图二的格式不同是否会影响使用？如果影响，如何用bio-linux系统修改序列由图一变成图二？

  • CC 2019-07-06 23:59