GWAS的Bonferroni校正阈值

我查阅很多GWAS类的文献,对于Bonferroni校正阈值有几点不太理解。有的文献阈值是p=1/n(n为标记数),有的文献是p=0.05/n(n为标记数),还有一些文献内容里面标记数是10的7次方,然后基于0.05的Bonferroni校正,p值达到10的-13次方。请问这么小的p值是怎么算出来的?应该采用哪种阈值呢?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

p=0.05/n(n为标记数)  p=0.01/n(n为标记数) 都是可以的,这就是Bonferroni校正。做GWAS分析现在用重测序技术也就是利用SNP标记进行关联分析,重测序数据SNP的标记至少都是百万级的。所以通过矫正之后p值就很小了; 

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  • kuku93 提出于 2019-10-30 14:51

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