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5 叶绿体基因组组装过滤代码错误

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tgsgapcloser报错

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我输入docker run那条指令后，出现了以下报错，输入docker search omicsclass也出现报错。

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sam文件转换成bam文件是不能识别头部信息

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基因组组装BUSCO多拷贝过高

  • 2025-09-17 09:25
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老师您好，我做比较基因组时，orthofinder2运行时出现报错，这是什么原因？该如何解决。请老师解答

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Docker和比较基因组02.gene_family的orthofinder老是报错？？？

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为什么启动镜像时总是出现这样的报错啊老师

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用GenomeScope软件预测基因组偏小

1 解决

T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

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docker pull omicsclass/genome-comparison:v1.0无法下载镜像如何解决

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allhic进行染色体挂载，分组过程k=20，只分了一个组出了

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我想问一下在进行WGD分析时，要算复制时间，基于物种进化速率的公式：The divergent time of the whole-genome triplication (WGT) event was calculated using the formula divergence dateKs / 2r.

  • jpq 2025-05-26 15:37
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基因组使用ont.fasta数据补gap时报错

  • _He. 2025-06-30 18:25
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请问，基因完整序列位置是在gff注释文件中寻找吗？如下基因AUR62002649的基因位置在Chr03的44543929到44575315？相当于这个基因有31386个碱基长度？

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三代HIFI数据的格式

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老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

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老师您好，我在运行OrthoFinder2时，出现下面报错，请老师解答

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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件，但是两者之间有差异，像是缺了几列是怎么回事，如下面详述，请解答