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braker.pl运行中断

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老师，我想知道我在用你们演示的玉米数据提取cds和pep的脚本为什么都运行不对，第一个我是用了你们给的TransDecoder下载地址。第二张图用5.7版本的自己的数据是输出空文件

  • aa1 2025-01-08 19:57
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二代和三代sv数据合并出现问题，若能回答，万分感谢

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10 在国家基因组下载的基因组信息是这样，请问下面这一步该怎么修改

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GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题

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老师，我提取cds ，pep用基因的ID，作为序列的ID命令。运行出来"No such file or directory; can't open file ./.longest_isoform.gff3"但是我打开输出文件看是有数据的。是不是不用管No such file or direc...提示

  • aa1 2025-01-09 16:36
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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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在运行table_annovar.pl脚本的时候报错

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比较基因组构建进化树，通过seqkit进行序列合并时内存爆满导致kill

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群体sv分析

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5 juicer 报错： Failure during chimera handling of

1 解决

Hic挂载时 K值选择

  • _He. 2025-04-23 08:48
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老师，gff文件保留最长转录本有蓝色那一行的可以输出成功，上面没有那行输出的就是空白文件，我想知道没有蓝色那行的gff文件是不是可以自己照着格式写一行

  • aa1 2025-01-07 23:47
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基因结构注释效果不理想

2 解决

10 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后，染色体出现了一个超级染色体，各染色体大小分布非常不均匀

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5 叶绿体基因组组装过滤代码错误

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关于填充gap后的polish

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verkko组装后怎么生成.hic和.assembly文件

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老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛基因编号文件和泛基因列表一样，不知道为什么

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老师，我更换镜像了，但本地镜像一直加载不了，显示如下。然后，我在服务器上，导入镜像，运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析，然而，运行镜像时一直出错，进不去，错误显示如下。