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老师 我想问一下就是这个snp的统计是哪里呀 我视频里面看啦 说是SNP_gene_ann.stat里面的最后一列total ，但是我统计出来有一千五百多万，才36个个体 会不会太多了呀，还是直接wc -l对vcf文件进行统计呀

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5 想请问安捷伦双通道芯片数据得到了cy5和cy3通道的数据，想要做一些其它的分析，请问可以单独提取cy5的数据吗？然后对cy5中的数据重新进行别的分析？比如细胞类型反卷积之类的

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docker 镜像求助

  • CWR 2024-09-27 00:24
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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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基因组组装着丝粒问题

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在做系统发育树时遇到了问题

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请问大家，为什么将含有序列的文本txt格式改为fasta之后，用MEGA打开显示空白，直接打开文本也是显示空白

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老师您好，在做GWAS分析的时候，性状数据不是连续的数字，是0，1这种，这样的数据也可以按照上课讲的流程分析吗？性状数据没有多年数据，在后续的分析步骤中，不定义tassel_trait这个变量可以吗？

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老师 就是 您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传过滤的条件有一点不一样 那个才是对的或者两个都对 我截屏放一次下面啦 您看一下

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运行go_enrich.r报错

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老师我在做泛基因家族分析里面的泛基因列表构建，生成last.txt文件非常慢，帮忙修改命令

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搜集的gff3文件；第一列不同，有的是chr，有的是id；这个影响吗？

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putty下载基因组数据太慢

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甲基化图谱可以直观的展示整个基因组甲基化的情况，绘图前我们需要准备如下文件

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老师您好 就是我在上docker第五节课的时候 为什么下载不了第三方的镜像啊

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老师您好，在经过您的2024转录代谢培训班后，我自己运行WGCNA是出现卡住的问题

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vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

  • Max 2024-12-21 21:52
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重测序分析docker

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5 请问泛基因家族分析实操课程中老师用到的泛基因列表为什么和课程泛基因集构建得到的列表不一样呢？

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lncRNA测序，如何把四种RNA分离，或者只提取mRNA