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根据覆盖度及比对率如何剔除样品、gatk VariantFiltration过滤

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老师，麻烦您解答一下

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HiC-Pro使用

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请问，我弄了一个256线程，1t内存的服务器，想处理500G的宏基因组注释，大概需要跑多少天，全套下来

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比较基因组镜像无法加载

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3 关于泛基因组的pangene.list

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差异表达分析

  • lw 2024-08-19 15:55
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老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了

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请问老师这个LDA图中的other为什莫会出现呢，如何去除，直接在图里截掉，这样可不可以呢

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10 gvcf文件转vcf文件，创建索引时一直失败，请问

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var.txt大小为0怎么解决

  • WHR 2024-06-27 17:25
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juicebox有些染色体内没有互作信号正常吗

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使用fq文件去重脚本出现问题

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MCScanX没有结果怎么用circos作图

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老师 就是在计较基因组学哪里 请问一下下面这些物种的这些物种怎么下载它的genome.fasta和gff3啊 我在ensemble plant和jgi上都没找到，而且在ncbi上找到下载啦 打不开，，这种要怎么解决啊，

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进行metastat分析时报错

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泛基因组核心基因和可变基因长度比较core_pan_gene_compare.r报错

  • Q_C 2024-12-02 18:46
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安装本地docker出现错误

  • 李 2024-10-29 12:58
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SNP数据统计

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老师 就是Rhododendron_delavayi 和Rhododendron_irroratum这两种植物，我把它的fasta和gff3文件下载，然后做各物种的cds和pep文件提取，文件都能出来，但是就是出来的文件是空的，这个问题要怎么处理啊，麻烦老师帮我看一下，谢谢