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提取cds 用基因的ID，作为序列的ID，报错，咋整？

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为挂载到染色体上的基因家族成员能否绘制基因在染色体上的定位图？

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RNA-SEQ分析中，基因ID位于Chr01-Chr09的基因的reads数目全部是0

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老师您好，我在运行这段代码时没有任何反应，请问是出现了什么问题？Oryza文件里是水稻的参考基因组

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序列相似的家族基因如何设计荧光定量引物？

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pav分析，在写文章的时候应该如何写怎么到PAV呢？我是通过课程输入代码来的，写文章怎么写呢？

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hmmsearch --domtblout ./${ind}.WRKY_hmmerOut.txt --cut_tc ./WRKY.hmm ./${ind}.gene.pep.fasta;;我有两个结构域，需要如何更改呢？

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我用gemma做小麦的gwas分析，到最后一步生成曼哈顿图时出错，是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗，应该怎么老师解答

  • 2025-07-10 03:28
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老师，我有两个分级性状，需要进行BLUP嘛

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老师您好，我的重测序数据在NCBI上按照（双端下载是这样：https://www.omicsclass.com/article/1703）这个教程下载的，但是在做数据质控的时候总是报错，以下是数据，您看看哪儿存在问题。

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卸载重装后docker后为啥docker pull omicsclass/organelle-assembly:v1.0怎么下载不了这个镜像了

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老师您好，我在参考基因组比对的时候，出现报错，请老师解答

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按照课程输入命令，但是报错显示没有这个命令

  • zjc 2025-04-23 11:14
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GWAS分析筛选关联区域

  • John 2025-03-11 18:46
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老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

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老师，我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令；视频中data数据中为gff的后缀，我的数据是gff3的，把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗？

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想获得某个染色体序列，命令是啥？

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T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

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treemix分析

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我想问一下在进行WGD分析时，要算复制时间，基于物种进化速率的公式：The divergent time of the whole-genome triplication (WGT) event was calculated using the formula divergence dateKs / 2r.

  • jpq 2025-05-26 15:37