Linux命令处理文件合并

Linux命令处理文件合并

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  • 安生水
  • 发布于 2024-08-07 16:03
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group_by()和any()连用判断每个分组中的元素是否满足特定条件

如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。

MITE_Hunter 第六步报错 aln not exits

MITE属于II类非自主转座因子,可以使用MITE_Hunter进行检测,MITE_Hunter的运行一共有8步。 1. 报错信息 在运行第六步(-S 6)的时候出现报错: 2. 报错原因 发现第六步执行: 在MITE_...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-08-05 10:36
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火山云 | tos:// 数据下载 | windows/linux下载方式

01:windows | 通过 共享链接 登录 TOS Browser 软件(版本> v1.7.0)下载 01-1:在本地电脑下载TOS Browser 软件,安装包网址:https://www.volcengine.com/docs/6349/148777 01-2:双击...

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  • rzx
  • 发布于 2024-08-01 11:34
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IF=5.7 | 转录组数据揭示类风湿关节炎的临床诊断模型

​“ 2024年6月Frontiers in immunology 杂志发表了一篇题为Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram mo...

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  • rzx
  • 发布于 2024-07-30 15:50
  • 阅读 ( 1718 )

组装"预实验" | 基因组调研图

基因组调研图有助于了解即将组装的这个物种的基因组复杂程度,为后续的正式的基因组组装去提供一些依据。基因组的复杂程度可以从基因组大小,倍性,杂合度,重复率等方面去进行评价。 用什么来...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-30 15:39
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SCTransform ,Error: useNames = NA is defunct

SCTransform在seuratv4的时候没问题,升级到v5的时候不工作,出现报错 > brain <- SCTransform(rep, assay = "Spatial", verbose = TRUE)Running SCTransform on assay: SpatialRunning SC...

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  • xun
  • 发布于 2024-07-25 15:37
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RunUMAP函数报错,

执行降维分析的函数,umpa的时候报错 brain <- RunUMAP(brain, reduction = "pca", dims = 1:30) 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) :   function '...

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  • xun
  • 发布于 2024-07-25 14:15
  • 阅读 ( 1643 )

绘制全基因组甲基化图谱

绘制全基因组甲基化图谱

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  • 安生水
  • 发布于 2024-07-25 14:08
  • 阅读 ( 1332 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-07-25 11:01
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B/T细胞分类:

B细胞分类:

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  • 发布于 2024-07-25 09:50
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

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  • 发布于 2024-07-24 16:38
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌(NSCLC)(GSE127465)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌(NSCLC)(GSE127465)

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  • 发布于 2024-07-24 11:11
  • 阅读 ( 1669 )

biom格式的文件如何转化

biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的 先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys l...

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  • xun
  • 发布于 2024-07-23 15:29
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌(HCC)(GSE149614)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌(HCC)(GSE149614)

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  • 发布于 2024-07-23 10:33
  • 阅读 ( 1813 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

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  • 发布于 2024-07-22 18:21
  • 阅读 ( 1156 )

R语言跑循环,如何跳过报错信息?

当使用循环跑R函数的时候,如果其中某一次循环执行时报错,那么就会中断循环体,并在屏幕上打印出报错信息

甲基化水平如何计算

甲基化水平如何计算

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  • 安生水
  • 发布于 2024-07-11 09:51
  • 阅读 ( 2206 )

add a Convex Hull with module

有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...

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  • xun
  • 发布于 2024-07-11 09:20
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给进化树标定化石时间

进化树(Phylogenetic Tree)是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每个分支点(节点)代表一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-10 17:43
  • 阅读 ( 2817 )