转录组个性化分析之可变剪切分析工具:rMATS turbo

转录组个性化分析之可变剪切分析工具:rMATS turbo

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-04-01 11:36
  • 阅读 ( 160 )

GATK 4.4.0报错“ A JNI error has occurred, please check your installation and try again”

报错 在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错: 报错的主要信息用红框框出了,错误信息是:错误为发生JNI错误,请检查安装并重试。 出现报错的原因: 1. javac与java版本...

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2024-03-25 11:54
  • 阅读 ( 244 )

windows安装Aspera Connect软件

windows安装Aspera Connect软件

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-03-22 17:29
  • 阅读 ( 174 )

在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍: Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件,由go语言编写,功能比较完善,软件使用也很稳定。 下载链接:https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式: 1. 点...

  • 0
  • 1
  • rzx
  • 发布于 2024-03-19 17:01
  • 阅读 ( 163 )

bcftools创建vcf索引失败

bcftools创建vcf索引失败

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-03-18 13:44
  • 阅读 ( 133 )

GFF或GTF格式转bed

GFF或GTF格式转bed

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-03-14 14:02
  • 阅读 ( 164 )

使用bcftools文件提取vcf文件子集

1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下: Chr1    11787600        11793521Chr1    30028805        30042382Chr1    54966087        54970283Chr1    57228272     ...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2024-03-11 18:13
  • 阅读 ( 193 )

HISAT2比对时报错|(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

我有12个样本在进行HISAT2比对时有3个样本出现报错(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) 运行脚本: hisat2 -p 10 --rg-id=L2 --rg SM:L2 --rg LB:L2 --rg PL:ILLUMINA -x iwgsc_re...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2024-03-07 10:12
  • 阅读 ( 187 )

使用fastp软件对fastq文件进行剪切

使用fastp软件对fastq文件进行剪切

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-02-22 17:33
  • 阅读 ( 383 )

vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题

fa最新版vscode登录时会报错,因为一些系统基础软件版本太低了,所以如果不想回退版本,就需要更新一下 ▶ ldd --version #来看一眼自己的glibc版本 ldd (GNU libc) 2.37 Copyright (C) 2023...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2024-02-02 14:24
  • 阅读 ( 462 )

lnd无法下载样本名称含有+的数据

linuxnd linuxnd是linux系统下载诺禾致源测序数据的软件,其基础功能如list、cp、cp -d 已经在这篇文章中给大家列出: https://www.omicsclass.com/article/2084 错误的产生 该软件在遇到...

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-31 10:52
  • 阅读 ( 411 )

代谢组数据上传NGDC!简单又快捷!

代谢组数据上传NGDC!简单又快捷!

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-01-30 17:59
  • 阅读 ( 867 )

CLUMPAK安装

CLUMPAK这个软件很古老,安装起来也很麻烦,记录一下https://tau.evolseq.net/clumpak/download/CLUMPAK.zip 安装包下载路径解压以后添加库的位置到环境 export PERL5LIB=path/CLUMPAK:$PERL5LI...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2024-01-26 17:02
  • 阅读 ( 515 )

rMATS turbo使用

rMATS turbo使用

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-01-17 11:30
  • 阅读 ( 608 )

seqcluster软件安装

seqcluster软件安装

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-01-10 13:38
  • 阅读 ( 553 )

超快的文件传输软件trzsz

对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2024-01-09 10:56
  • 阅读 ( 454 )

LTR_HARVEST的并行软件LTR_HARVEST_parallel

在对基因组进行评估的时候,LAI是连贯性完整性的指标之一。目前经常使用的计算 LAI 的软件是 LTR_retriever,他并非是一个单一的工具,而是通过整合多个LTR预测软件的结果,过滤其中的假阳性LTR...

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-04 14:29
  • 阅读 ( 567 )

BaiduPCS-Go上传经常出错

使用BaiduPCS-Go上传文件经常出现错误,检查一下版本 直接使用软件自带的不一定下载成功 ,所以手动下载一下,这个版本直接解压就行,有需要的可以下一下,不需要编译了, BaiduPCS-Go-v3.9.5-li...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2024-01-02 15:54
  • 阅读 ( 417 )

BLINK(C版本) 进行 GWAS分析的教程

  • 0
  • 0
  • 星莓
  • 发布于 2023-12-27 11:31
  • 阅读 ( 913 )