利用vcftools分析玉米和大刍草基因组区域或基因区域是否受到选择

通过已经发表的玉米和大刍草基因组变异数据来计算感兴趣的基因组位置上,是否受到选择。主要是比较大刍草和玉米之间,该区间的多样性是否会下降,如果该区域内SNP的多态性下降,表明该区域内受到了选择。

R语言中转换成dummy dummy-variables 虚拟变量

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  • 发布于 2023-12-21 15:11
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群体遗传进化与GWAS分析镜像更新2.0

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  • 发布于 2023-10-07 16:15
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大家好啊,新手一枚,请多关照哈

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  • 李奕辰
  • 发布于 2022-03-21 23:10
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GWAS,TWAS,eQTL,EWAS等的关系定义

eQTL 基因组变异和转录组之间的关系(健康和疾病状态) GWAS 基因组变异和表型之间的关系 TWAS 基因表达和表型之间的关系

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  • 发布于 2022-01-12 13:38
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gwas课程中 建树

ggtree.r. t fatsttree nek -f $ GROUP -g Group -n fasttree

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  • 猫爪草
  • 发布于 2022-01-06 14:52
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GWAS模型描述方法

https://mran.microsoft.com/snapshot/2018-04-07/web/packages/lmem.gwaser/lmem.gwaser.pdf

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  • 发布于 2021-12-27 12:09
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基因(加性、显性、上位性)效应

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群体遗传进化与GWAS分析动植物文献

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  • 发布于 2021-11-22 12:32
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GWAS分析哪个模型最优

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影响GWAS关联分析好坏的因素

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GWAS根据遗传率和QTL的数量产出模拟表型数据

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GWAS模型介绍

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混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值

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IF=8.78|非肿瘤数据挖掘思路(GWAS Catalog)

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GWAS cFDR 多效基因分析

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GWAS抗性性状处理,耐盐,耐寒,耐旱等

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混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值 计算育种值与GWAS表型性状数据整合

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tassel 模型公式表示方法

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GWAS中P值的筛选阈值原理是什么

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