宏基因组 - 文章 - 组学大讲堂问答社区

组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

对于qiiem2更新细节的一些描述

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Omics_Kurisu
发布于 2023-01-06 13:26
阅读 ( 372 )

qiime2分类器的训练

训练分类器 Training classifier 因为不同实验的扩增区域不同，鉴定物种分类的精度不同，提前的训练可以让分类结果更准确。在本教程中，使用到的是已经训练好细菌V4区的分类器，可在QIIME2官网...

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Omics_Kurisu
发布于 2022-11-14 15:26
阅读 ( 317 )

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错：

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omicsgene
发布于 2022-10-29 10:07
阅读 ( 480 )

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级；tax_bar_plot.r

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omicsgene
发布于 2022-07-27 11:11
阅读 ( 517 )

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

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omicsgene
发布于 2022-02-14 13:07
阅读 ( 913 )

qiime2 18S 分类器构建

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omicsgene
发布于 2021-08-06 10:32
阅读 ( 1578 )

环境因子分析

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omicsgene
发布于 2021-02-26 15:28
阅读 ( 4519 )

扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

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omicsgene
发布于 2021-02-24 11:57
阅读 ( 1721 )

qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

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omicsgene
发布于 2021-01-04 15:29
阅读 ( 2483 )

利用qiime2对微生物扩增子测序数据文库根据barcode信息拆分数据

Demultiplexing and Trimming Adapters from Reads with q2-cutadapt

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omicsgene
发布于 2020-12-23 11:09
阅读 ( 5081 )

机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

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omicsgene
发布于 2020-12-18 20:06
阅读 ( 1744 )

bugbase指定表型预测

Bugbase除了生成默认九种表型的预测文件，在本地运行还可以指定表型对样品进行预测

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Morii
发布于 2020-12-14 12:00
阅读 ( 1815 )

PCAI型标尺与II型标尺

I型标尺与II型标尺

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omicsgene
发布于 2020-12-02 22:13
阅读 ( 2426 )

肠道微生物诊断慢性肾病-随机森林分析文献复现 IF=15分文章

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omicsgene
发布于 2020-12-01 15:59
阅读 ( 3936 )

方差分解分析（Variance Partitioning Analysis）

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omicsgene
发布于 2020-11-22 20:19
阅读 ( 10928 )

envfit()的线性拟合：非约束排序（PCA、CA、PCoA、NMDS）

非约束排序（PCA、CA、PCoA、NMDS）中被动拟合解释变量

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omicsgene
发布于 2020-11-22 20:03
阅读 ( 6854 )

qiime2 分类器建立 SILVA数据库

https://forum.qiime2.org/t/processing-filtering-and-evaluating-the-silva-database-and-other-reference-sequence-data-with-rescript/15494

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omicsgene
发布于 2020-11-21 08:24
阅读 ( 5522 )

环境微生物领域杂志影响因子

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omicsgene
发布于 2020-11-13 13:22
阅读 ( 1434 )

人工智能（AI）在微生物组中的应用-随机森林分类与回归预测

机器学习-随机森林微生物中的应用-分类与预测

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omicsgene
发布于 2020-11-10 14:17
阅读 ( 4487 )

qiime2 vsearch OTU 以及 ASV流程整理

qiime2 vsearch OTU pip 整理

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omicsgene
发布于 2020-11-06 13:17
阅读 ( 5997 )