微生物与环境因子,代谢物,功能等相关性分析linkET

微生物与环境因子,代谢物,功能等相关性分析linkET

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-19 08:20
  • 阅读 ( 540 )

微生物多样性扩增子(16S/18S/ITS)课程更新v2.0

微生物多样性扩增子(16S/18S/ITS)课程更新v2.0

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-05 13:25
  • 阅读 ( 550 )

泌尿感染(UTIs)宏基因组分析

泌尿感染(UTIs)宏基因组分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-26 21:25
  • 阅读 ( 326 )

qiime2 q2-picrust2 报错问题

qiime2 q2-picrust2 报错问题

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-30 13:21
  • 阅读 ( 468 )

PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-24 11:42
  • 阅读 ( 898 )

picrust1 16S 微生物功能预测

picrust 16S 微生物功能预测

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-18 15:16
  • 阅读 ( 349 )

lefse 运行报错python3中

lefse 运行报错python3中

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-18 14:38
  • 阅读 ( 417 )

宏病毒组分析一区

宏病毒组分析一区

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-09-07 09:28
  • 阅读 ( 470 )

kraken2生成的biom文件处理

使用kraken2软件做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候,如果后续不使用bracken则可能会遇到一个问题,结果生成的biom文件中taxonomy并不是最终结果,比如下面这样 可以用脚本来处理,删...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-05-31 17:33
  • 阅读 ( 752 )

组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

对于qiiem2更新细节的一些描述

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-01-06 13:26
  • 阅读 ( 1851 )

qiime2分类器的训练

训练分类器 Training classifier 因为不同实验的扩增区域不同,鉴定物种分类的精度不同,提前的训练可以让分类结果更准确。在本教程中,使用到的是已经训练好细菌V4区的分类器,可在QIIME2官网...

  • 0
  • 2
  • xun
  • 发布于 2022-11-14 15:26
  • 阅读 ( 1642 )

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-10-29 10:07
  • 阅读 ( 1833 )

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-07-27 11:11
  • 阅读 ( 1226 )

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-02-14 13:07
  • 阅读 ( 1496 )

qiime2 18S 分类器构建

qiime2 18S 分类器构建

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-08-06 10:32
  • 阅读 ( 2602 )

环境因子分析

环境因子分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-02-26 15:28
  • 阅读 ( 7228 )

扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-02-24 11:57
  • 阅读 ( 2431 )

qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-01-04 15:29
  • 阅读 ( 3581 )

利用qiime2对微生物扩增子测序数据文库根据barcode信息拆分数据

Demultiplexing and Trimming Adapters from Reads with q2-cutadapt

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-23 11:09
  • 阅读 ( 7319 )

机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-18 20:06
  • 阅读 ( 2631 )