qiime2分类器的训练

训练分类器 Training classifier 因为不同实验的扩增区域不同,鉴定物种分类的精度不同,提前的训练可以让分类结果更准确。在本教程中,使用到的是已经训练好细菌V4区的分类器,可在QIIME2官网...

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-10-29 10:07
  • 阅读 ( 119 )

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-07-27 11:11
  • 阅读 ( 361 )

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-02-14 13:07
  • 阅读 ( 756 )

qiime2 18S 分类器构建

qiime2 18S 分类器构建

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-08-06 10:32
  • 阅读 ( 1284 )

环境因子分析

环境因子分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-02-26 15:28
  • 阅读 ( 3929 )

扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-02-24 11:57
  • 阅读 ( 1503 )

qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-01-04 15:29
  • 阅读 ( 2173 )

利用qiime2对微生物扩增子测序数据文库根据barcode信息拆分数据

Demultiplexing and Trimming Adapters from Reads with q2-cutadapt

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-23 11:09
  • 阅读 ( 4483 )

机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-18 20:06
  • 阅读 ( 1475 )

bugbase指定表型预测

Bugbase除了生成默认九种表型的预测文件,在本地运行还可以指定表型对样品进行预测

  • 0
  • 0
  • Morii
  • 发布于 2020-12-14 12:00
  • 阅读 ( 1541 )

PCAI型标尺与II型标尺

I型标尺与II型标尺

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-02 22:13
  • 阅读 ( 2007 )

肠道微生物诊断慢性肾病-随机森林分析文献复现 IF=15分文章

肠道微生物诊断慢性肾病-随机森林分析文献复现 IF=15分文章

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-01 15:59
  • 阅读 ( 2940 )

方差分解分析(Variance Partitioning Analysis)

方差分解分析(Variance Partitioning Analysis)

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-22 20:19
  • 阅读 ( 9986 )

envfit()的线性拟合:非约束排序(PCA、CA、PCoA、NMDS)

非约束排序(PCA、CA、PCoA、NMDS)中被动拟合解释变量

  • 2
  • 2
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-22 20:03
  • 阅读 ( 5922 )

qiime2 分类器建立 SILVA数据库

https://forum.qiime2.org/t/processing-filtering-and-evaluating-the-silva-database-and-other-reference-sequence-data-with-rescript/15494

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-21 08:24
  • 阅读 ( 4790 )

环境微生物领域杂志影响因子

环境微生物领域杂志影响因子

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-13 13:22
  • 阅读 ( 1224 )

人工智能(AI)在微生物组中的应用-随机森林分类与回归预测

机器学习-随机森林微生物中的应用-分类与预测

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-10 14:17
  • 阅读 ( 3880 )

qiime2 vsearch OTU 以及 ASV流程整理

qiime2 vsearch OTU pip 整理

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-06 13:17
  • 阅读 ( 5305 )

qiime2自己建立分类器 greengene

自己建立分类器

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-06 10:26
  • 阅读 ( 3383 )