老师您好，请问在群体遗传进化中，模板数据黄瓜的分组，sample 是指的什么？是测序数据下机的样品编号？

不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件，后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt？

• 0
• 0
• shidandan
• 发布于 2023-11-02 09:41
• 阅读 ( 125 )

基因组重测序docker镜像更新到2.0

基因组重测序docker镜像更新到2.0

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2023-10-16 10:12
• 阅读 ( 206 )

CNVnator 安装报错

CNVnator 安装报错

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2023-10-11 14:42
• 阅读 ( 142 )

ANNOVAR 基于gff中基因的位置简单注释

ANNOVAR 基于gff中基因的位置简单注释

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2023-06-13 09:46
• 阅读 ( 316 )

stacks RAD 分析方法

stacks RAD 分析方法

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2023-04-19 13:40
• 阅读 ( 426 )

多款软件进行vcf合并--gatk、vcftools、bcftools

链接：https://www.jianshu.com/p/116c8e4c93f4

• 0
• 0
• 星莓
• 发布于 2022-09-21 18:00
• 阅读 ( 3155 )

GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析

GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2022-02-11 16:14
• 阅读 ( 2598 )

vcf文件annovar的注释结果绘制瀑布图maftools分析

vcf文件annovar的注释结果绘制瀑布图maftools分析

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2022-01-04 13:04
• 阅读 ( 2261 )

bcftools call SNP

bcftools call SNP

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2021-09-22 18:16
• 阅读 ( 1484 )

BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的

BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2020-07-21 13:02
• 阅读 ( 3105 )

BSA分析中QTL-seq 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的

BSA分析中QTL-seq 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2020-07-21 12:51
• 阅读 ( 3604 )

GATK Hard-filter 过滤变异结果推荐阈值

GATK Hard-filter 过滤变异结果推荐阈值

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2020-06-25 09:38
• 阅读 ( 5076 )

BSA分析之MutMap分析原理详解！

BSA分析之MutMap分析原理详解！

• 0
• 2
• omicsgene
• 发布于 2020-06-08 13:32
• 阅读 ( 6129 )

SNP指纹图谱软件SNPT

SNP指纹图谱软件SNPT

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2019-12-12 16:26
• 阅读 ( 3215 )

BSA分析算法中的ED算法和SNP-index有什么区别？

ED和snp-index是进行BSA基因定位时最常用的算法，本文简述了两者的区别。

• 3
• 8
• omics007
• 发布于 2019-08-02 12:30
• 阅读 ( 13677 )

外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤癌与FAM160A1基因突变相关

外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤与FAM160A1基因突变相关

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2019-05-24 16:55
• 阅读 ( 2412 )

外显子测序解析卵巢早衰的遗传因素

外显子 测序

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2019-05-24 16:51
• 阅读 ( 1971 )

变异结果 vcf 格式转换成 hapmap格式

格式转换

• 0
• 2
• omicsgene
• 发布于 2019-05-09 15:38
• 阅读 ( 7552 )

遗传图不同群体

遗传图

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-10-10 16:59
• 阅读 ( 1842 )

MutMap+和mutmap分析差异（BSA）

MutMap+和mutmap分析差异，一个为啥用SNP-index就可以，另外一个为啥用ΔSNP-index

• 0
• 1
• omicsgene
• 发布于 2018-07-30 14:27
• 阅读 ( 10283 )