不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件,后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt?
基因组重测序docker镜像更新到2.0
CNVnator 安装报错
ANNOVAR 基于gff中基因的位置简单注释
stacks RAD 分析方法
链接:https://www.jianshu.com/p/116c8e4c93f4
GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析
vcf文件annovar的注释结果绘制瀑布图maftools分析
bcftools call SNP
BSA分析中MutMap 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的
BSA分析中QTL-seq 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的
GATK Hard-filter 过滤变异结果推荐阈值
BSA分析之MutMap分析原理详解!
SNP指纹图谱软件SNPT
ED和snp-index是进行BSA基因定位时最常用的算法,本文简述了两者的区别。
外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤与FAM160A1基因突变相关
外显子 测序
遗传图
MutMap+和mutmap分析差异,一个为啥用SNP-index就可以,另外一个为啥用ΔSNP-index