叶绿体或线粒体基因组重复序列分类及鉴定

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  • 星莓
  • 发布于 2023-11-29 11:45
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使用 mygene.info 获取基因注释信息

特简介 在生物信息学研究中,获取准确和全面的基因注释信息是至关重要的。mygene.info是一个提供全面、准确和最新基因注释信息的在线服务。该服务由Scripps研究所提供,并以RESTful API的形式...

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  • xun
  • 发布于 2023-09-12 15:56
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NCBI的SRA Lite和SRA Normalized数据有什么区别

有时候我们从NCBI下载SRA文件时会发现,会有SRA Lite和SRA Normalized两种类型的数据,前者后缀是.sralite,其文件大小也比原始的SRA文件要小。这两种数据的区别是什么呢?

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  • 星莓
  • 发布于 2023-06-08 14:29
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bam文件格式详解

BAM就是SAM的二进制文件,具有更小的存储空间,并且许多下游分析工具使用的是BAM格式。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-05-16 10:00
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回归分析中R2的意义

回归分析中R2指的是结果变量(y)的观测值与y的拟合(即预测)值之间的相关系数;因此,R的值将始终为正,范围为0至1。 相关系数R2:表示你的曲线线性是否很好,理想状态是1,但是达不到。一般...

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  • rzx
  • 发布于 2023-05-10 11:51
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典型相关性分析CCA与冗余分析RDA

1.典型相关(CCA)的基本原理canonical correspondence analysis  典型相关分析是研究两组变量之间关系的一种多变量统计分析方法,它可以反映两组变量之间的相互依赖的线性关系。设两组变量用x1...

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  • rzx
  • 发布于 2023-05-09 17:37
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OPLS-DA分析

OPLS-DA分析,全称正交偏最小二乘法判别分析(OrthogonalPartialLeast Squares-DiscriminantAnalysis),它是在PLS-DA分析方法基础上,加入了正交变换的矫正,能够将X矩阵分解成与Y相关和不相关...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-17 10:43
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ceRNA网络构建

ceRNA全称competing endogenouse RNA, 中文叫做竞争性內源RNA。和ncRNA等概念不同,ceRNA并不是代表某种特定类型的RNA,而是一种调控机制。 通俗来讲,在这种调控模式中,ceRNA指生物体内复杂的...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-06 11:56
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基因组重复序列分类

重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段,在植物基因组中占有很大比重,根据重复序列在植物基因组中的组织方式不同进行分类。

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-29 17:42
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NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta,gff3,gtf,gb文件等

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta,gff3,gtf,gb文件,以及获得细胞器基因组的全部基因名称

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-05 14:58
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区分cds utr.exon

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fasta格式文件介绍 What is FASTA format?

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-08-16 16:51
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LASSO 回归分析原理与R语言实现

用R语言中的glmnet包进行LASSO运算,我的目的是想建立一个Cox model分析肿瘤与各个因素的关系,如何实现?

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-03-30 15:51
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Kaplan-Meier生存分析中三种检验方法(log-rank、breslow、tarone)的比较

Kaplan-Meier生存分析中三种检验方法(log-rank、breslow、tarone)的比较

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-03-30 15:48
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好实验从一个好的样本命名开始!

常年混迹于生物测序行业,每天见的最多的是各种各样的生物样品,干的最多的就是区分样品,一千个样品有一千种命名方式:有用阿拉伯数字顺序下来的;有用汉字的;有名中带特殊字符的。殊不知,如...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-01-08 22:16
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和导师闹翻怎么办?当代研究生的日常困境

导师与学生之间关系的讨论与反思,是值得我们进一步去推敲的。

怎样提高论文投稿命中率?这些“潜规则“你一定要知道!

血泪总结之——论文投稿中的那些“潜规则。

快速查找电脑中目标文件的方法

转录组结果那么多,差异统计在哪里?注释结果在哪里?原始数据在哪里?我连文件名都忘了,还有得救吗?看完本文让你豁然开朗!

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  • omics007
  • 发布于 2019-07-04 13:37
  • 阅读 ( 2559 )

相关系数小结

相关系数

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  • 安生水
  • 发布于 2019-06-14 16:34
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科研汪专属花式表情包,不懂不是科研人!

每个行业都有自己的梗,科研领域也不例外。