空间转录组实操课程
空间转录组（Spatial Transcriptomics）与单细胞转录组（Single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）是当前高通量转录组研究的两大前沿技术。空间转录组 可以在保持组织切片原有空间结构的前提下，检测不同区域的基因表达情况。可用于研究组织微环境、细胞间相互作用、器官发育、肿瘤异质性等依赖于空间定位的问题。比如：可以区分肿瘤核心区和边缘区的免疫浸润差异。
转录组测序的发展
Bulk RNAseq：在这一阶段，对大量混合细胞进行转录组测序，能够获得大量细胞 的基因平均表达水平。这种方法虽然可以提供整体的基因表达图谱，但无法解析单个细胞的特异 性基因表达情况。 Single cell RNA sequencing (scRNAseq):空转转录组测序技术的发展，使得研究人员能够对单个细胞的基因表达情 况进行测量。通过这种方法，可以揭示不同细胞类型之间的基因表达差异，并有助于理解细胞异 质性和发育过程中的基因调控机制。 Spatial RNA sequencing (spRNASeq):空间转录组测序技术是最新的发展，它不仅可以获取细胞的基因表达数据，还 能提供细胞在组织中的空间位置信息。这种技术对于理解细胞与其微环境之间的相互作用、组织 结构的形成以及疾病中的空间基因表达变化具有重要意义。
《空间转录组分析实操》课程简介
空间转录组测序已经被广泛地应用到生命科学研究的各个领域。为了让同学们尽快熟悉空间转录组测序的基本原理和数据分析方法，组学大讲堂特录制《空间胞转录组分析实操》视频课程，课程主要讲解空间转录组测序实验原理和基于10x Genomics平台的空间转录组测序数据分析方法。
《空间转录组分析实操》课程目录
本课程共32个小节，具体目录如下：
课程特色
1. 课程内容丰富：囊括了实验原理和基于10x Genomics平台的空间转录组测序数据的标准分析和高级分析；2. 分析结果图表为发表级，可以直接用于文章撰写；3. 分析环境基于docker一键搭建完成，解决了各种生信软件安装的烦恼；
4. 所有代码封装，可快速批量运行，简介高效。
5.从原始数据到分析结果，采用同一套示例数据连贯讲解，不像其他课程只是讲解文章示例代码，应用到自己数据可能会发生各种报错；
学习渠道
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https://bdtcd.xetlk.com/s/2Xg4ac
- 发表于 1天前
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- 分类：转录组
