MarkDuplicates (GATK)报错:打开的文件句柄过多(Too many open files)

使用GATK对bam文件进行去重操作的时候发现报错了

Rna-seq 去除批次效应ComBat-seq

ComBat-seq

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  • 发布于 2024-01-09 10:54
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RNA分类

RNA分类

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  • 发布于 2023-10-17 17:54
  • 阅读 ( 294 )

有参转录组数据分析镜像升级v2.0

有参转录组数据分析镜像升级v2.0

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  • 发布于 2023-10-09 11:54
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blastp 快速比对注释基因,输出注释信息

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...

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  • 发布于 2022-11-21 16:35
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eggNOG 注注释报near "WITHOUT": syntax error

eggnog-mapper 注释

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  • 发布于 2022-11-16 15:44
  • 阅读 ( 941 )

mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

解决老牌植物软件mapman出图的bincode与图上的binname不匹配

loom 文件转换成Seurat对象

loom 文件转换成Seurat对象

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  • 发布于 2022-06-24 22:43
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Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

Infercnv|单细胞转录组拷贝数分析

Infercnv|单细胞转录组拷贝数分析

cellphoneDB|单细胞分析之细胞间通讯分析

cellphoneDB|单细胞分析之细胞间通讯分析

IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践

IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践

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  • 发布于 2022-06-09 16:52
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单细胞转录组测序简介

单细胞转录组测序简介

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  • 发布于 2022-05-26 09:38
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如何鉴定长距离运输的mRNA?

上一期给大家介绍了一篇如何鉴定嫁接中长距离运输mRNA的方法:嫁接中长距离运输的mRNA是如何鉴定的?今天给大家介绍已经发表的第2种鉴定长距离运输的mRNA的方法,两者方法类似,但也各有不同,...

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  • 发布于 2022-03-25 20:43
  • 阅读 ( 1291 )

从原始测序数据开始分析单细胞数据

umi tools

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  • 发布于 2022-02-10 13:51
  • 阅读 ( 1575 )

NBT同时两篇文章:单细胞数据分析流程 比较

单细胞数据分析流程 比较

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  • 发布于 2022-01-24 11:36
  • 阅读 ( 1109 )

R包hdf5r安装失败 SeuratDisk 安装失败

R包hdf5r安装失败 SeuratDisk 安装失败

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  • 发布于 2022-01-22 10:23
  • 阅读 ( 3967 )

外显子比对率太低,参考基因组索引建立refFlat.txt文件有问题:

转录组索引

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  • 发布于 2022-01-13 09:57
  • 阅读 ( 2104 )

EggNOG基因序列批量注释

介绍EGGnog数据库批量注释基因

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  • 发布于 2021-10-09 12:08
  • 阅读 ( 6015 )

SNP分析中由于基因组序列过长导致报错解决方法

SNP分析中由于基因组序列过长导致报错解决方法

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  • 安生水
  • 发布于 2021-09-17 16:11
  • 阅读 ( 3349 )