不管是重测序或者是有参转录组,很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说,常用比对软件都可以正常运行结束,但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题,这些问题有的时候...
https://www.bilibili.com/video/BV1Ct421H7ST/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&vd_source=6cc688872dbaeabe125ff35d0ca9e710
修改单细胞转录组分组
人免疫细胞marker基因
monocle2 igraph 报错
KEGG 通路基因列表;
KEGG GO 富集显著性图 名字太长,柱状图上文字解决
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.18.456898v1.full
单细胞分析 质控 线粒体 红细胞 核糖体
SCP FeatureDimPlot 报错
10X 单细胞原始数据下载
feature 重要性排序棒棒糖图
seurat subset之后再聚类报错:
CAFs 细胞类型细分
HISAT和STAR比对软件比较
SAW 空间转录组参考基因组制作
兰花发育中器官发生的时空图谱数据下载示例
华大stereo-seq 添加上底片转换成10X格式方便scanpy和seurat读入分析
SAW华大时空软件使用