monocle3分析结果解读

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细胞通讯cellchat结果介绍

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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌(GSE123813)

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单细胞数据挖掘示例代码

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GO富集分析统计表中差异基因数量不一致

GO富集分析统计表中差异基因数量不一致

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  • 安生水
  • 发布于 2024-03-04 11:29
  • 阅读 ( 334 )

MarkDuplicates (GATK)报错:打开的文件句柄过多(Too many open files)

使用GATK对bam文件进行去重操作的时候发现报错了

Rna-seq 去除批次效应ComBat-seq

ComBat-seq

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-01-09 10:54
  • 阅读 ( 664 )

RNA分类

RNA分类

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  • rzx
  • 发布于 2023-10-17 17:54
  • 阅读 ( 528 )

有参转录组数据分析镜像升级v2.0

有参转录组数据分析镜像升级v2.0

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-09 11:54
  • 阅读 ( 941 )

blastp 快速比对注释基因,输出注释信息

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-21 16:35
  • 阅读 ( 977 )

eggNOG 注注释报near "WITHOUT": syntax error

eggnog-mapper 注释

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-16 15:44
  • 阅读 ( 1232 )

mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

解决老牌植物软件mapman出图的bincode与图上的binname不匹配

loom 文件转换成Seurat对象

loom 文件转换成Seurat对象

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-06-24 22:43
  • 阅读 ( 1384 )

Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

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Infercnv|单细胞转录组拷贝数分析

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cellphoneDB|单细胞分析之细胞间通讯分析

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IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-06-09 16:52
  • 阅读 ( 3636 )

单细胞转录组测序简介

单细胞转录组测序简介

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-05-26 09:38
  • 阅读 ( 3410 )

IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-05-26 09:33
  • 阅读 ( 2631 )