使用Python jcvi 时遇到的报错 ,如:FileNotFoundError,如何解决

关于JCVI的使用,唐老师在github上已经有很详细的介绍,网络上也有很多教程。JCVI依赖的东西非常多,因此在使用时还是难免遇到各种问题,以在使用Python  JCVI,遇到FileNotFoundError为例,...

gff文件格式不标准的修改脚本

gff文件第三列一般有gene,mRNA,CDS,exon等等信息,但是有时候我们下载的gff文件没有gene信息,只有mRNA等等的信息,我们可以实用脚本手动校正。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-04-07 16:02
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二叉树算法介绍

二叉树是一种非常重要的数据结构,它在计算机科学和软件工程中有着广泛的应用。本文将对二叉树进行简要介绍,并给出几个实际应用的例子。 一、二叉树简介 二叉树是一种树形数据结构,其中每个...

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  • xun
  • 发布于 2023-04-07 13:33
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stack的利用

Python中可以使用栈(stack)数据结构来分析数据。下面是一个使用栈来判断一个字符串中的括号是否匹配的例子: 在这个例子中,我们首先定义了一个空的栈(stack),然后遍历字符串中的每一个...

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  • 发布于 2023-04-06 15:59
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Linux 服务器 安装Jupyter notebook 并开启远程访问

Linux 安装Jupyter notebook 并开启远程访问

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-01-13 15:52
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sklearn中使用pipeline重复处理测试集

pipeline 实现了对全部步骤的流式化封装和管理,可以很方便地使参数集在新数据集上被重复使用。 可以用于下面几处: 模块化 Feature Transform 自动化 Grid Search 自动化 Ensemble Generat...

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  • xun
  • 发布于 2022-11-07 15:06
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Biopython之序列输入

Biopython

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  • 安生水
  • 发布于 2022-10-25 10:19
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python操作大文件删除某行

删掉文件其中一行,非常简单,不过如果一个文件很大以至于无法读到内存里,又该怎么操作呢 其实我们可以使用 open() 方法把需要修改的文件打开为两个文件,然后逐行读入内存,找到需要删除的行...

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  • xun
  • 发布于 2022-10-24 16:10
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使用map()、filter()来做到函数式编程

一般来说,大部分工作的规模不至于需要定义类,可是顺着下去写代码在之后的调试,修改都比较麻烦,这种情况下,可以尝试使用函数式编程 函数式编程,顾名思义,整个代码都由相互独立的纯函数构...

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  • xun
  • 发布于 2022-09-19 17:11
  • 阅读 ( 378 )

python中列表、字符串和数组之间的互相转换

python中列表、字符串和数组之间的互相转换

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  • 星莓
  • 发布于 2022-09-15 16:29
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使用python绘制卡方分布函数(一)

卡方分布是一种特殊的伽马分布,堪称统计学中应用最广泛的概率分布,很多不需要统计学的行业应该也听说过大名鼎鼎的西格玛分布,也是他的别称。他的泛用毋庸置疑,可非数学出生的计算这个还是颇...

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  • xun
  • 发布于 2022-09-09 13:26
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python运行单细胞umap报错

python运行单细胞umap报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-03-21 14:20
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单细胞 TypeError: load() missing 1 required positional argument: 'Loader'

TypeError: load() missing 1 required positional argument: 'Loader'

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-01-21 16:36
  • 阅读 ( 3060 )

Python中运行时出现SyntaxError报错

Python中运行时出现SyntaxError报错

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  • 安生水
  • 发布于 2021-11-05 15:06
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筛选编码蛋白的CDS序列

筛选编码蛋白的CDS序列

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-07-02 09:50
  • 阅读 ( 1308 )

anaconda快速搭建python学习环境-windows

anaconda快速搭建python学习环境-windows

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-03-09 16:57
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R was not built as a library python 中 rpy2 报错

R was not built as a library rpy2 报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2020-10-20 10:17
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Python 操作 读取 写出 Excel 文件 提高工作效率

Python 操作 Excel

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  • 发布于 2020-07-13 17:38
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利用biopython将cds序列翻译成蛋白序列

利用biopython将cds序列翻译成蛋白序列

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  • 发布于 2020-02-24 11:50
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win10/win7系统下无法重命名和打开文件提示文件名太长怎么解决

win10/win7系统下无法重命名和打开文件提示文件名太长怎么解决

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  • 发布于 2019-12-10 16:27
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