安生水
R语言跑循环，如何跳过报错信息？
当使用循环跑R函数的时候，如果其中某一次循环执行时报错，那么就会中断循环体，并在屏幕上打印出报错信息
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- 发布于 2024-07-12 17:50
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每天学习一点点
对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包
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- 发布于 2024-07-05 14:39
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eQTplot包绘图报错解决：“Caused by error in `db_collect()`”
解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题
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- 发布于 2024-06-30 09:52
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eQTpLot包的安装
eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包，专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入，以生成一系列图表，可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。
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- 发布于 2024-06-26 16:06
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使用peer根据表达量数据推断隐藏因子
在做eQTL分析时需要提供隐藏因子作为分析的部分协变量，分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素，例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等，这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的，但是会影响基因表达的因素)，需要进行预先处理。
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- 发布于 2024-06-19 15:39
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omicsgene
基于 gff 文件构建 TxDb 包
TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...
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- 安生水
- 发布于 2024-05-15 16:45
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在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件
libpcre2-8.so.0是PCRE（Perl Compatible Regular Expressions）库的一个版本，通常用于支持正则表达式。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-04-30 16:14
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R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
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- omicsgene
- 发布于 2024-04-16 15:38
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一些常见R代码的报错和解决办法
Error: cannot allocate vector of size X Gb 这种问题尤其在32位R版本中常见，因为它们对可用内存有限制。即使在64位版本中，当数据集非常大时也可能遇到内存问题。解决这个问题通常需要优化...
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- xun
- 发布于 2024-03-25 14:39
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xun
R语言“had non-zero exit status”安装报错
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- 星莓
- 发布于 2024-03-05 10:53
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星莓
绘制venn图报错Unexpected parameter length for "category"
在进行韦恩图绘制的时候出现报错： 出现这个报错的原因是在输入数据应当是一个有名字的list，要求是这个list中的每个元素都有名字。 venn <- list(A,B,C)names(venn) <- c("A","B",...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-03-01 17:25
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Ti Amo
R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程
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- 星莓
- 发布于 2024-02-23 17:10
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R| set.seed()作用使随机结果具有复现性
例如在R语言中，rnorm()函数为随机生成多个随机数，每次使用都会得到不同的结果 > rnorm(3) [1] -2.0235077 0.3552526 0.6239982 > rnorm(3) [1] 1.101044 -1.297740 1.717356 如...
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- rzx
- 发布于 2024-02-19 14:26
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rzx
使用R语言安装包编译时gcc标准报错——“error: for loop initial declarations are only allowed in C99 mode”
使用BiocManager安装R包时gcc标准报错
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-01-26 10:52
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