全部 - 文章 - 第5页 - 组学大讲堂问答社区

绘制Upset 图

Upset 图（Upset Plot）是一种用于可视化集合间交集的图表，是传统维恩图的替代方法，特别适用于集合个数多或交集关系复杂的场景。它通过柱状图、点图和辅助条形图来直观展示集合交集的大小及分布。

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安生水
发布于 2024-11-28 11:01
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组装"预实验" | 物种倍性分析

倍性直接影响基因组的大小和复杂性，不同倍性的物种需要不同的组装策略，了解物种的倍性对于基因组组装至关重要

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Ti Amo
发布于 2024-11-25 15:22
阅读 ( 1511 )

annovar的染色体识别问题

如果是非数字形式的染色体编号（尤其是其中有特殊字符），annovar的注释可能会有问题，需要改成数字格式

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每天学习一点点
发布于 2024-11-22 10:02
阅读 ( 722 )

甲基化水平计算

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安生水
发布于 2024-11-21 14:20
阅读 ( 1263 )

scanpy 中 ScTransform分析：

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omicsgene
发布于 2024-11-20 08:23
阅读 ( 1151 )

seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选

seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除

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rzx
发布于 2024-11-19 19:01
阅读 ( 896 )

R 安装github包报错：

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omicsgene
发布于 2024-11-18 15:42
阅读 ( 1224 )

R公式中如何加入变量

expression（）函数是没办法同时代入公式和变量，这个时候我们可以使用另一个函数来替代——bquote（）

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每天学习一点点
发布于 2024-11-15 17:57
阅读 ( 965 )

空间转录组数据读取

10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...

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xun
发布于 2024-11-13 16:56
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IF=13.8 | 甘油/二醇脱水酶是后肠发酵食肉动物肠道微生物群的关键功能

“ 2024年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Trait-based study predicts glycerol/diol dehydratases as a key function of the gut microbiota of hindgut-fermenting carnivores(Saccha...

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xun
发布于 2024-11-13 10:44
阅读 ( 849 )

核苷酸多样性π的计算

核苷酸多样性（nucleotide diversity），记为π，是分子遗传学中一个重要的概念，可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平，也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...

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Ti Amo
发布于 2024-11-12 18:14
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IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...