预测miRNA前体

1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...

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  • rzx
  • 发布于 2023-11-01 15:25
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预测miRNA前体

1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...

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  • rzx
  • 发布于 2023-11-01 15:25
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siRNA

什么是siRNA ? siRNA(small interfering RNA 小干扰RNA) 是由 20-25 个核苷酸组成的双链 RNA 分子。一般3’端有两个游离的碱基,通过RNA干扰途径沉默目标基因。 RNA干扰(RNAi) 在RNA干扰...

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  • rzx
  • 发布于 2023-10-18 14:16
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在使用miRDeep进行miRNA预测的时候报错

运行命令:Rhi_mature.fa 是物种miRNA成熟序列;Rhi_hairpin.fa 是物种miRNA前体序列; perl otal_reads_collapsed_vs_genome.arf none -d  -g 100000 -l 500  -m 11 -v -P -n d 报错: T...

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  • rzx
  • 发布于 2023-09-05 13:27
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miRNA合成以及miRNA命名

miRNA合成过程,以及miRNA命名方式,编号规则

关于miRNA你知道多少?

一、miRNA的定义 miRNA(microRNA)是一组由基因组编码的长度约20~23个核苷酸的非编码RNA,通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。 miRNA在物种进化中相当保守,...

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  • Morii
  • 发布于 2020-11-18 11:52
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miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库

miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库

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  • microRNA
  • 发布于 2018-10-12 16:41
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miRWalk: 一个预测人类miRNA靶基因的网站

miRWalk: 一个预测人类miRNA靶基因的网站

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  • microRNA
  • 发布于 2018-09-18 11:48
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