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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-20 10:06
  • 阅读 ( 4906 )

分子生物学纪要:(1)

分子生物学

linux:简单使用(2)

linux

推荐一个好用文献管理软件:CNKI E-Study——数字化学习与研究平台(1)

CNKI E-Study——数字化学习与研究平台的学习使用

R语言、文件读取(2)

R、R语言、文件读取、xlsx

python的简单使用和安装相应的包

python

linux的简单命令(一)

linux

R语言、ggplot2的简单绘图(1)

初探ggplot2

linux常用命令整理之文件解压缩:

linux常用命令整理之文件解压缩:tar命令:解压:tar xvf FileName.tar压缩:tar cvf FileName.tar DirName gz命令解压:gunzip FileName.gz压缩:gzip FileName zip命令解压:unzip File...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-18 13:03
  • 阅读 ( 2634 )

转录组数据挖掘的几个建议

如何挖掘数据?明确研究目的,实验方案设计,关注已知的结果,结合表型,进行突破

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-18 11:28
  • 阅读 ( 4658 )

Python虚拟环境解决不兼容问题

采用Python 虚拟环境,解决python不同版本,不同包 间不相容的问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-18 10:11
  • 阅读 ( 3006 )

pip安装python模块

python模块安装还是非常简单的,只要把pip安装好之后,一切都用一条命令搞定。 如果你使用的是从 python.org 下载的Python 2 >=2.7.9 或者Python 3 >=3.4,那么pip是已经安装了。 1....

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:47
  • 阅读 ( 2536 )

提取bam/sam文件指定区域reads

若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads,可以使用samtools和bedtools来实现。  首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID,第二三列分别为起始终止位置               ...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:34
  • 阅读 ( 14966 )

微生物多样性分析之Bray curtis距离

 Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的主要基于OTUs的计数统计比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离包含的信息完全不一样相比于jaccard距...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:21
  • 阅读 ( 16563 )

NCBI检索叶绿体基因并快速下载

叶绿体是绿色植物进行光合作用的细胞器,具有合成蛋白质、淀粉、色素等功能,普遍存在于真核自养生物中,尤其是藻类和陆生植物,其基因组可自主遗传。叶绿体基因组序列对于研究植物物种起源,进化演变及不同物种间的亲缘关系等具有重要意义。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 08:52
  • 阅读 ( 15833 )

如何将SNP标记转化成可跑胶验证的CAPS标记

现如今,基于高通量测序得到的SNP信息无疑是海量的,然而SNP标记的验证却并不容易实现。其最好的验证方式是一代sanger测序,不过价格较高,而且通量低。如果SNP刚好位于酶切位点上,就可以将其转化为CAPS标记,利用跑胶的方式对其进行验证,既便宜又好用。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 08:46
  • 阅读 ( 10862 )

微生物组间差异分析之LEfSe

lefse分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-17 21:52
  • 阅读 ( 33697 )

给大家推荐两个预测植物顺势作用元件的网站

Plant CARE 地址:http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/ PLACE 地址:https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/sogo.cgi?lang=en&pj=640&action=page&pag...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-17 17:29
  • 阅读 ( 11655 )

内参基因的筛选

筛选内参基因

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-17 13:18
  • 阅读 ( 6112 )

blast序列比对中E值是什么意思?

E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-17 10:45
  • 阅读 ( 18274 )