在线版fimo程序做转录因子结合位点预测

meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点,这里介绍一下他的在线版用法。

meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点,这里介绍一下他的在线版用法。

首先,选择输入motif文件,需要meme格式。

attachments-2018-07-5KoRBmvq5b484329eb106.jpg

然后输入查询的序列,选择我们准备好的序列文件。

attachments-2018-07-oNuEwJDL5b4843b781bb3.jpg

最后输入邮箱,工作描述,也可不填。

attachments-2018-07-zqOjLwlu5b4844ad73d0c.jpg

还可修改匹配的p值,默认为 1E-4,最后点击“Start Search”就可以了。

可以将该网页添加到收藏夹,方便以后查看结果。






  • 发表于 2018-07-13 14:27
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  • 分类:软件工具

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安生水
安生水

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