做微生物研究必懂的OTU table相关知识

微生物多样性分析中最基础、最重要的文件为OTU table,因此理解OTU table的含义和来路,对微生物多样性分析至关重要。本文介绍OTU table是怎么样一步一步得来的,及其注意事项。

  • 1
  • 3
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:53
  • 阅读 ( 28455 )

微生物多样性alpha分析看不明白?看这里!

在微生物多样性分析的报告中主要包括五个部分:Alpha多样性分析、Beta多样性分析、物种组成分析、进化关系分析、差异分析,本文主要介绍Alpha多样性分析的结果。

  • 4
  • 15
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:31
  • 阅读 ( 58709 )

看懂变异记录结果文件(VCF)

做过DNA重测序,群体遗传进化,BSA,GWAS等项目的人都会遇到VCF文件,这个文件记录了全基因组的变异信息,如果不懂VCF文件就无法进行后续分析。

  • 3
  • 8
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:29
  • 阅读 ( 24003 )

Beta多样性分析

Beta多样性用于不同生态系统之间多样性的比较,也就是样品间的差异,详细介绍beta多样性结果内容及意义。

  • 2
  • 9
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:25
  • 阅读 ( 14991 )

加权基因共表达网络(WGCNA)寻找与疾病相关的hub基因

低成本发一篇sci,你也可以的!!!快来围观吧!

  • 4
  • 6
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:22
  • 阅读 ( 7272 )

你不知道的微生物互作分析方法

16s测序数据除了进行常规的Alpha多样性分析,Beta多样性分析,以及PCA分析之外,还能做什么?

  • 1
  • 3
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-20 19:07
  • 阅读 ( 16286 )