今天给大家分享一下最近刚发在Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据,数据量贼大,分析的也贼细致,如果咱们自己做的也是PBMC的数据,可以把它当作一个标杆进行参考。
在单细胞方面本研究的核心内容可以概括为:
做了什么数据/规模多大:对 428 名中国健康成人(20–77 岁) 的 PBMC 进行多组学测定,包含 scRNA-seq 约 648 万细胞、scATAC-seq 约 376 万细胞,并配套 WGS 基因型及血浆脂质/代谢/生化等表型信息。
免疫细胞图谱与分辨率:通过分层注释体系将细胞细分到 73 种免疫细胞类型(最细的亚群分类),并把 scRNA 与 scATAC 进行整合以实现跨模态一致标注。
衰老/性别相关的免疫变化:在细胞比例、分子层面(转录/染色质等)系统分析了与 年龄和性别相关的差异与驱动因子(如某些细胞比例随年龄变化、部分基因表达随年龄改变等)。
73种PBMC细胞的Marker:复制下边连接:https://db.cngb.org/trueblood/cima/cellType
当然也有附录:PBMC_marker-science.xlsx.zip
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