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关于SNP填充、推断方面的问题

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利用命令行进行sra数据下载有如下报错

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老师，用GSDS２.０把基因结构和保守基序绘在同一张图里（像下面那张图一样），“Gene Features （基因位置信息）”和“Other Features to Display (保守基序)”需要以什么样的格式输入呢？

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请问在linux当中执行sed命令时出现Operation not permitted的提示该怎么解决

  • 2020-08-15 21:23
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比较基因组学共线性

  • 荣 2020-08-15 14:30
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进化树美化时颜色设置后没有反应

  • 2020-08-15 14:00
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docker 运行meme motif analysis 时显示无meme文件

  • 2020-08-15 13:53
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我购买了你们基因家族分析的视频，但是看不太懂，有更详细的共线性分析配置文件的准备吗？

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请问一下进化树构建出来怎么分析结果呢？

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老师，GSDS分析顺式作用元件的时候，legend显示不完整怎么保存pdf

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比较基因组学共线性分析

  • 荣 2020-08-15 01:55
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老师，在ensemble下载斑马鱼和大黄鱼的时候，gff3文件和pep等的ID不统一的，老师给的脚本无法使用，我现在还没能看懂脚本并修改（捂脸）

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mcscan共线性分析

  • 荣 2020-08-14 23:19
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老师，比如说我要做两个物种基因家族的对比分析，那我要不要选一个中间物种与这两个构建成一个进化树进行对比？

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关于TCGA临床数据中非数值类型的数据如何处理？如图划线部分，这些肿瘤分型数据如何转化为数值，有没有参照的标准，性别这种可以用1,2代替，但类型多的数据如何处理呢？感谢老师!

  • dilf 2020-08-13 17:35
1 解决

15 有关TBTOOLS做出三连图后显示不统一的问题

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5 提取保守结构域

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您好老师，我想问一下我利用gffread把gff文件转换成gtf时，老提示duplicate/invalid 'mRNA' feature ID=BjuA000594。我研究的物种没有gff3文件，谢谢老师。

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R正在运行的时候崩了，数据可以找回吗？

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老师您好，我按照GEO芯片数据挖掘课堂上所讲的内容，通过网站直接下载了葡萄GSE = "GSE36128"和 GPL = "GPL13936"，如何能通过避免代码下载的方式获得expressionMatrix.csv,sampleTreatmentdetail.csv以及platformAnnotation.csv这三个文件?