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第一张图是geo直接下载的矩阵文件，是经校准的log数值，而在按照大讲堂标准化处理的课程，我标准化处理后形成的文件不是矩阵类型，而且每个基因的值是 “一串数字；个位数”的格式（如图二所示），请老师解释一下这种数值是什么意思，我应该如何转化成矩阵那样的数据呢？

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5 如果geo下载的矩阵是标准化的但没有去log，那我利用这个矩阵用Excel计算出log值以后再用lima包进行差异分析吗？还是说需要重新下载原始数据用r进行标准化处理呢？

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老师，CDD搜索鉴定结构域，对于命中类型是superfamily的基因，怎么判断它属不属于该家族呢？麻烦老师了

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阈值太大怎么办

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找不到ID对应的蛋白质序列，，，，怎么办

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附图，，，，请问阈值太大了怎么筛选

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红框之内的就是我的问题所在，请您看看，谢谢！

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请问下列这个是报错了吗？这是一个通过id提取蛋白质序列的脚本

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像藻类这种低级生物，基因家族怎样才能找的更全面？

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基因家族分析，通过blast方法只提取出了五个蛋白质序列怎么办？

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为什么提取出来的蛋白质ID，通过Perl脚本找不到它的序列呢？

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TBtools安装包在基因家族分析课程的软件里没有，下载链接也没有，请问这样的课程是不是还有改进的地方

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R语言源码安装包报错！

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老师，如果用CDD(Batch CD-Search)搜索鉴定，出现这种情况，通常是什么原因？

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10 MCScanX制作pep.fa出现错误，请问怎么解决

  • 2020-07-22 19:09
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我用MCScan跑的染色体共线性图结果中，只显示出两条染色体，大部分用一个数线表示是什么意思呢，求救大神~~

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5 进行基因家族成员鉴定的时候，是不是在hmmsearch搜索后，只要用CDD或Pfam鉴定出含有该基因家族的保守结构域，就可以认为该基因属于这个家族吗？

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图中的用蛋白分子量筛选，那个蛋白分子量的筛选范围是所有基因家族通用的，还是仅限于Hsp20基因家族

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有没有人会设计KASP标记？

  • 2020-07-21 21:18
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5 如图所示代码问题如何解决