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请问老师，宏基因组文件基因预测之后使用Salmon对基因丰度进行评估，发现有基因的ID重复，请问应该怎样修改？

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你好老师，我想问下转录组数据，有五个不同的处理，每个处理3个重复，一共15个样本，可以做WGCNA吗？

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20 我使用OrthoMCL处理blast产生的结orthomclBlastParser blastresult compliantFasta > similarSequences.txt，出现了问题，不知道怎么解决

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做转录组kegg富集分析时老是报错

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docker虚拟机安装失败

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docker 下载镜像磁盘空间不足： no space left on device

  • 2021-09-28 10:48
1 解决

GEO芯片数据挖掘课程中PCA分析

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老师您好，在您的课程《基因组重测序数据分析实操课程》中：变异结果注释ANNOVAR，在运行table_annovar.pl 如何解决报错：Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677

  • 智 2021-09-26 21:27
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在您的课程《基因组重测序数据分析实操课程》中：变异结果注释ANNOVAR，在运行table_annovar.pl 如何解决报错：Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677

  • 智 2021-09-26 21:11
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老师您好！ 我们之前购买了基于biolinux的基因家族分析课程，还没学完新的docker版教程就有了，这个需要重新买新的课程来学习吗

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请问mapman软件中的mapping 文件为什么会有重复注释的情况呢?

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你好，我和你遇到了同样的问题，请问你现在这个问题解决了吗？

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老师您好，请问使用mapman软件时为什么在网上下载的mapping文件中的identifier和我的基因id号会对不上呢?

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老师您好，我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据进行了选择清楚分析，获得了候选基因，我想请问一下筛选到的基因就是受到正选择的吗？需要怎样判断哪些基因受到正选择，哪些基因受到负选择？谢谢老师！

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老师您好，我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据进行了选择清楚分析，获得了候选基因，我想请问一下筛选到的基因就是受到正选择的吗？需要怎样判断哪些基因受到正选择，哪些基因受到负选择？谢谢老师！

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3 代码报错

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5 从ENA数据库下载fastq格式，可以点击这个进行下载吗？

  • TIES 2021-09-24 17:37
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老师问一下，我现在准备好了我的物种WRKY 蛋白的全长序列和拟南芥的WRKY蛋白全长序列。想仿照菠萝WRKY那篇文献做，但是菠萝那篇文献做多序列比对和进化树都是用WRKY domain 那一段序列做的。我怎么样才能把这些蛋白序列中的WRKY domain 那一段序列挑出来做进化树和多序列比对呢？

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代码报错

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老师你好，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量我有几个不同浓度胁迫下的转录组数据，想利用此数据分析一下某基因家族，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量?依据表达量画差异表达图？

  • 2021-09-24 14:44