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10 老师，想请问一下，Kaks_caculator在linux中怎么安装，有没有软件资源

  • 2020-04-18 09:37
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20 老师，请问做基因上游顺式元件分析时，只有cds文件，gff文件和pep文件，该如何提取promoter序列

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10 老师，请问只有gff文件，cds文件和pep文件，该如何做基因上游顺式元件分析

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使用命令提取gene_exon_info.gff文件时，我的OVATE_domain_new_out_removed_redundant.txt里这一列id（图一）只有绿色箭头标的这五个可以被输出（图二），是怎么回事呢？而且之前提取的IDlist（图三）也只有那五个对应在mRNAID下面，其他的都发生了错位，我是手动到excel里面转换过来的，希望老师解答一下，我这是哪一步出了错误，卡在这里很久了。

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老师eclipse安装epic提示版本不匹配麻烦您能看一下吗？

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在GSDS获得基因结构图时，我的gff文件里有40条，结果图上只有五条，是怎么回事呢？

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老师，请问一下，用TBtools打开meme.xml文件出现报错，这种情况是怎么回事呢？

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GSDS error 报错

  • Iron 2020-04-17 08:16
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请问怎么在电脑上安装Linux

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ka/ks利用课程脚本输出了一对完全一样的串联重复基因但mcsacnX做图时为啥没显示串联重复基因

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老师，您好，最近做的bHLH转录因子的文章，我做序列比对的时候需要先知道它有几个亚家族吗是要从亚家族里边找出来几个氨基酸序列进行比对，怎么确认水稻和拟南芥属于这个亚家族，还是把物种的所有序列都比对，比如，拟南芥有二百多条，水稻有一百多条等，谢谢您

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怎么在hmmsearch的XXX.out结果里，截取基因ID，L最后再提取序列？Linux系统下怎么编码

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老师您好，我想分析样本的甲基化数据，但是TCGA里的脑肿瘤只有肿瘤样本，我能从GEO中下载健康样本的甲基化450的数据，可以吗？

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关于KA/KS的计算和种内圈图

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100 如何提取一个冷门物种（NCBI下载）的CDS序列

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10 老师你好，最近我在使用tbtool的blast时发生报错

  • LGC 2020-04-15 03:10
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关于KAKS的方法选择以及密码子选择

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20 NCBI的数据库更新了，两份数据文件用哪个？

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10 请问老师有没有get_gene_position.pl，get_gene_bed.pl，get_fa_by_id_from_bed.pl这个三个脚本的下载地址？

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bootstrap consensus tree的nwk文件不能正常打开