VCF文件按照指定的染色体排序

合并不同种质的g.vcf文件生成vcf文件,但是vcf文件中染色体的排序比较乱。我用了如下的命令来改变vcf文件中染色体的排序(java -jar picard.jar SortVcf \      I=my_input.vcf \

O=my_sorted_output.vcf \    SD=sequence_dictitionary.dict)。运行后,出现了Unable to access jarfile picard.jar。麻烦看看怎样解决。

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

后面要跟这个文件的路径:picard.jar


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Ti Amo

picard.jar换成绝对路径

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  • 郭老师 提出于 1天前

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