老师,在初步查看cluster分群信息时,能否使用--cols代码,实现对某个cluster的颜色进行改变,具体代码是什么

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

对的可以的,设置自己喜欢的16进制颜色列表:https://htmlcolorcodes.com/zh/

例如: 多个颜色加引号,空格隔开,颜色数量要和分组数量相同

Rscript $scripts/seurat_DimPlot.r -i oscc.added.celltype.qs \
   --reduction umap  --label --group.by celltype \
 -p DimPlot.tsne  --pt.size 0.1 \
--cols "#D1C3AD" "#EEE572" "#CEDCE6" "#AFBF94" "#B9927F"
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  • HHHHHH 提出于 5天前

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