年大米
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3天前 关注了问题

GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况

3天前 关注了问题

GWAS 曼哈顿 Manhattan 图像问题

3天前 关注了问题

我用gemma做小麦的gwas分析，到最后一步生成曼哈顿图时出错，是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗，应该怎么老师解答

5天前 发起提问

老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？