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重测率，比对率

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T2T基因组组装与注释第16步最后一行代码为什么运行不了？

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你好，请问之前你未成环的问题解决了吗？我想问问使用了什么方法，抱歉打扰到你

  • x123 2024-09-08 10:58
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保留蛋白质编码基因找不到gff文件，但是我是指定了路径的，而且ll也能找到这个文件，这个文件ee查看也看不出来问题

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老师 就是 您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传过滤的条件有一点不一样 那个才是对的或者两个都对 我截屏放一次下面啦 您看一下

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老师您好，我在保存镜像时报错了，请问这是什么原因呢

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老师您好，做GWAS分析使用GLM模型时，p值为什么都是-0啊？

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请问大家，为什么将含有序列的文本txt格式改为fasta之后，用MEGA打开显示空白，直接打开文本也是显示空白

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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我想请教一下16s高级扩增子分析中的，微生物共存网络的问题，在“确定物种间存在相互作用关系的阈值，将相关性R矩阵内不符合的数据转换为0”这步中，按照视频中给的代码进行操作后报错，原因是矩阵中有缺失值，请问这个缺失值如何处理，把他如何赋值为0？

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vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

  • Max 2024-12-21 21:52
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重测序

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老师 我想问一下就是这个snp的统计是哪里呀 我视频里面看啦 说是SNP_gene_ann.stat里面的最后一列total ，但是我统计出来有一千五百多万，才36个个体 会不会太多了呀，还是直接wc -l对vcf文件进行统计呀

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可以给我分享一下您的基因家族镜像吗

  • 2025-04-07 11:02
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宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表，混合组装呢

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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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请问老师您知道如何从protein folding and protein-small molecule interaction algorithms方面预测目标蛋白质的功能吗

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老师您好，我用plantcare分析顺式作用元件时，只要一上传文件就报错，上传文本（一条序列）的话能正常出结果，不知道这是什么情况

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老师 就是我做到cafe进化树这里 就是做出来k=2 3 4 5这几个结果文件是空的

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运行go_enrich.r报错