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我做有参转录组数据分析，一共有30个样，每个样有3个重复。在做比对这一步时，我发现30个样中，有两个样，它们各有一个重复的比对率只有50％，而其他的样比对率均有80％以上，请问这样会对实验结果有影响吗？

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hisat2 reads 与基因组进行比对出错

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5 如何找到差异基因的整体通路以及实现可视化？

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转录组基因表达差异分析分组问题，我是有3个样品数据，如下分别是Carambola_K007-01-T01（花序），Carambola_K007-01-T02（花苞），Carambola_K007-01-T01（叶），该如何分组呢

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最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析，在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题，应该是脚本的问题，具体问题如下

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如何通过转录组测序结果geneID“TRIAE_CS42_6DL_TGACv1_527316_AA1702110”找到对应的“TraesCS4A02G403700”这样的ID？

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基因在不同组织的表达量做热图

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就是在学习RNA-Seq数据差异分析时，出现上调和下调都为0的情况，全都是没有差异的基因，是否需要修改参数设置？

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基因的表达量和转录本的表达量

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Isoseq3流程CCS报错

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三代转录组和二代转录组取样上有什么区别吗？

  • 2019-09-04 13:59
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edger差异分析，如何查询分组差异的结果

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5 原核转录因子预测

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组内某个生物学重复样品与其它相关性不太好怎么办？对文章发表有影响吗？

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可变剪接事件在三代测序中未检测到，而在二代测序中检测到了的原因？

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做KEGG富集分析时，我有已知基因的k number，如何查找该基因的ko number？

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qRT-PCR 验证 RNA-seq 数据，材料必须是同一批处理的吗？

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5 我看了您的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》文章，想请教一个问题

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5 做重测序取样和做转录组取样要求一样吗？

  • 2019-08-25 09:48
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转录组数据下载

  • Llm 2019-08-23 09:38