20 无参转录组使用kobas进行KEGG分析的时候,应该选择什么物种?

因为我的物种是非模式植物,请问使用kobas3.0进行KEGG富集的时候,物种这个选项,是应该选择相近物种吗?还是选择pass,即不选物种,如果pass,那么富集出来的通路很多都是疾病的,我这个是植物,感觉非常不对啊。

希望能得到您的解答!

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最佳答案 2019-11-02 16:32

kobas 有现成的物种可以选择当然最好,但是,如果没有现成的物种应该分析不了,你需要重新注释自己物种里面的所有基因,对应到KEGG里面的通路,才可以分析;

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  • 提出于 2019-10-10 17:57