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转录组问题

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5 用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so reverse-determinize...”

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大家好，请问箱线图怎么分析

  • 2019-11-01 15:05
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十折交叉验证是啥意思

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GFF文件解释

  • 2019-10-25 11:06
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老师您好，我有个问题想请教您，就是以您看的文献来说，您觉得有转录因子调控CDPK激酶的文献，就是说转录因子可以和CDPK激酶的启动子结合的例子吗？因为我用某个CDPK酵母双杂交筛到了一个转录因子，现在不确定到底是这个转录因子结合了CDPK的启动子，还是这个CDPK激酶对这个转录因子磷酸化，对于它们的上下游关系我还不是太明白，是不是用CDPK筛到的转录因子就说明了什么关系呢它们之间

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请问如何根据已有转录组预测转录因子的靶基因？

  • 2019-10-23 18:21
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转录组中count值为什么要经过标准化，计算FPKM值来表示表达量？

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转录组数据里的count值是指什么？

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转录组差异分析里GO注释的图怎么看的？

  • 2019-10-21 11:04
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老师您好，我想问一下在做基因家族成员在植物各个组织器官中的表达量时（qPCR），一般是以哪一个器官为对照呢？是随意选的吗?我看有的文献是以根，有的是以茎的为对照，这是如何确定的呢

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我想参加10月北京转录组的培训，我是吉林农业大学的学生，咨询你们说没有长春的培训计划，请问外地去培训能不能给些优惠?比如打折或者联系便宜点的住宿

  • DC 2019-10-15 10:11
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差异基因数量太多，通过GO富集分析筛选一部分，再进行蛋白互作，可行吗？

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cytoscape绘图问题

1 解决

20 无参转录组使用kobas进行KEGG分析的时候，应该选择什么物种？

  • 2019-10-10 17:57
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请问GO富集文件gene2go和go2gene之间怎么转换？

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老师好，我想问一下，RSEM、FPKM和TPM是一个什么样的关系呢？reads count又有怎样的用途，与前面三个有关系吗？有一篇paper中说，The RNA-Seq by Expectation–Maximization (RSEM) expression values were used for statistical analysis.这是说统计学分析需要用RSEM标准化处理后才能进行吗？

  • QQ 2019-10-04 10:44
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无参转录组怎么分析？

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GO层级整理

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无参转录组比对达到多少。认可为相应基因？

  • yc 2019-09-28 16:07