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5 如何找到差异基因的整体通路以及实现可视化？

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转录组基因表达差异分析分组问题，我是有3个样品数据，如下分别是Carambola_K007-01-T01（花序），Carambola_K007-01-T02（花苞），Carambola_K007-01-T01（叶），该如何分组呢

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最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析，在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题，应该是脚本的问题，具体问题如下

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如何通过转录组测序结果geneID“TRIAE_CS42_6DL_TGACv1_527316_AA1702110”找到对应的“TraesCS4A02G403700”这样的ID？

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基因在不同组织的表达量做热图

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就是在学习RNA-Seq数据差异分析时，出现上调和下调都为0的情况，全都是没有差异的基因，是否需要修改参数设置？

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基因的表达量和转录本的表达量

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Isoseq3流程CCS报错

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三代转录组和二代转录组取样上有什么区别吗？

  • 2019-09-04 13:59
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edger差异分析，如何查询分组差异的结果

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5 原核转录因子预测

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组内某个生物学重复样品与其它相关性不太好怎么办？对文章发表有影响吗？

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可变剪接事件在三代测序中未检测到，而在二代测序中检测到了的原因？

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做KEGG富集分析时，我有已知基因的k number，如何查找该基因的ko number？

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qRT-PCR 验证 RNA-seq 数据，材料必须是同一批处理的吗？

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5 我看了您的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》文章，想请教一个问题

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5 做重测序取样和做转录组取样要求一样吗？

  • 2019-08-25 09:48
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转录组数据下载

  • Llm 2019-08-23 09:38
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5 请问如果要对转录组数据里的基因家族进行分类统计，统计一共有几个基因家族，每个家族有几个基因的话，有什么方法或者工具可以做到？

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计算RPKM值时，公式中需要用到的基因的转录本的长度值具体是从哪个参考基因组相关文件和说明命令获得的？求步骤，谢谢！